-
細菌の新奇生存戦略:L-form 細胞壁が有っても無くても細菌は生きられる
招待有り
塩見大輔, 林匡史, 大島拓
化学と生物62
(
1
)
2024年1月1日
-
Relationship between the Rod complex and peptidoglycan structure in Escherichia coli
査読有り
Risa Ago, Yuhei O. Tahara, Honoka Yamaguchi, Motoya Saito, Wakana Ito, Kaito Yamasaki, Taishi Kasai, Sho Okamoto, Taiki Chikada, Taku Oshima, Issey Osaka, Makoto Miyata, Hironori Niki, Daisuke Shiomi
MicrobiologyOpen12
(
5
)
2023年10月9日
-
D-amino Acids Ameliorate Experimental Colitis and Cholangitis by Inhibiting Growth of Proteobacteria: Potential Therapeutic Role in Inflammatory Bowel Disease.
査読有り
国際誌
Satoko Umeda, Tomohisa Sujino, Kentaro Miyamoto, Yusuke Yoshimatsu, Yosuke Harada, Keita Nishiyama, Yoshimasa Aoto, Keika Adachi, Naoki Hayashi, Kimiko Amafuji, Nobuko Moritoki, Shinsuke Shibata, Nobuo Sasaki, Masashi Mita, Shun Tanemoto, Keiko Ono, Yohei Mikami, Jumpei Sasabe, Kaoru Takabayashi, Naoki Hosoe, Toshihiko Suzuki, Toshiro Sato, Koji Atarashi, Toshiaki Teratani, Haruhiko Ogata, Nobuhiro Nakamoto, Daisuke Shiomi, Hiroshi Ashida, Takanori Kanai
Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
2023年8月9日
-
大腸菌 L-formの増殖における外膜の重要性
招待有り
査読有り
塩見大輔, 大島拓
生物物理誌63
(
1
)
27
-
29
2023年1月
-
壁をなくしてみたところ
招待有り
査読有り
大島 拓, 塩見 大輔
生物工学会誌100
(
3
)
137
-
137
2022年3月
-
Direct Observation of Conversion From Walled Cells to Wall-Deficient L-Form and Vice Versa in Escherichia coli Indicates the Essentiality of the Outer Membrane for Proliferation of L-Form Cells.
査読有り
国際誌
Taiki Chikada, Tomomi Kanai, Masafumi Hayashi, Taishi Kasai, Taku Oshima, Daisuke Shiomi
Frontiers in microbiology12
645965
-
645965
2021年3月
-
Alteration of Membrane Fluidity or Phospholipid Composition Perturbs Rotation of MreB Complexes in Escherichia coli.
査読有り
国際誌
Keisuke Kurita, Fumiya Kato, Daisuke Shiomi
Frontiers in molecular biosciences7
582660
-
582660
2020年
-
RodZ: A key-player in cell elongation and cell division in Escherichia coli
招待有り
査読有り
国際誌
Risa Ago, Daisuke Shiomi
AIMS Microbiology5
(
4
)
358
-
367
2019年11月
-
Division-site localization of RodZ is required for efficient Z ring formation in Escherichia coli.
査読有り
国際誌
Yoshii Y, Niki H, Shiomi D
Molecular microbiology111
(
5
)
1229
-
1244
2019年5月
-
Relation between rotation of MreB actin and cell width of Escherichia coli.
査読有り
国際誌
Kurita K, Shin R, Tabei T, Shiomi D
Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms24
(
3
)
259
-
265
2019年3月
-
MreBアクチンの細胞内局在と機能の制御機構
栗田恵輔, 塩見大輔
生物物理(Web)59
(
2
)
100‐102(J‐STAGE)
2019年
-
The periplasmic disordered domain of RodZ promotes its self-interaction in Escherichia coli
査読有り
国際誌
Ryosuke Ikebe, Yuri Kuwabara, Taiki Chikada, Hironori Niki, Daisuke Shiomi
Genes to Cells23
(
4
)
307
-
317
2018年4月1日
-
Erratum: Author Correction: ARC6-mediated Z ring-like structure formation of prokaryote-descended chloroplast FtsZ in Escherichia coli (Scientific reports (2017) 7 1 (3492))
Hiroki Irieda, Daisuke Shiomi
Scientific reports8
(
1
)
4876
2018年3月15日
-
Bacterial heterologous expression system for reconstitution of chloroplast inner division ring and evaluation of its contributors
査読有り
国際誌
Hiroki Irieda, Daisuke Shiomi
International Journal of Molecular Sciences19
(
2
)
2018年2月11日
-
Polar localization of MreB actin is inhibited by anionic phospholipids in the rod-shaped bacterium Escherichia coli (vol 63, pg 849, 2017)
招待有り
査読有り
Daisuke Shiomi
CURRENT GENETICS63
(
5
)
845
-
848
2017年10月
-
ARC6-mediated Z ring-like structure formation of prokaryote-descended chloroplast FtsZ in Escherichia coli
査読有り
Hiroki Irieda, Daisuke Shiomi
SCIENTIFIC REPORTS7
(
1
)
3492
2017年6月
-
Exclusion of assembled MreB by anionic phospholipids at cell poles confers cell polarity for bidirectional growth
査読有り
Takuma Kawazura, Kanon Matsumoto, Koki Kojima, Fumiya Kato, Tomomi Kanai, Hironori Niki, Daisuke Shiomi
MOLECULAR MICROBIOLOGY104
(
3
)
472
-
486
2017年5月
-
Rapid, precise quantification of bacterial cellular dimensions across a genomic-scale knockout library
査読有り
Tristan Ursell, Timothy K. Lee, Daisuke Shiomi, Handuo Shi, Carolina Tropini, Russell D. Monds, Alexandre Colavin, Gabriel Billings, Ilina Bhaya-Grossman, Michael Broxton, Bevan Emma Huang, Hironori Niki, Kerwyn Casey Huang
BMC BIOLOGY15
(
1
)
17
2017年2月
-
Regulation of bacterial cell shape revealed by single cell observations
招待有り
Daisuke Shiomi
Microscopy65
i9
-
i9
2016年
-
[Regulation of determination of bacterial shape].
査読有り
Shiomi D
Nihon saikingaku zasshi. Japanese journal of bacteriology69
(
4
)
557
-
564
2014年
-
A mutation in the promoter region of zipA, a component of the divisome, suppresses the shape defect of RodZ-deficient cells
査読有り
Daisuke Shiomi, Hironori Niki
MICROBIOLOGYOPEN2
(
5
)
798
-
810
2013年10月
-
Mutations in cell elongation genes mreB, mrdA and mrdB suppress the shape defect of RodZ-deficient cells
査読有り
Daisuke Shiomi, Atsushi Toyoda, Tomoyuki Aizu, Fumio Ejima, Asao Fujiyama, Tadasu Shini, Yuji Kohara, Hironori Niki
MOLECULAR MICROBIOLOGY87
(
5
)
1029
-
1044
2013年3月
-
A mutation of ispA that is involved in isoprenoid biogenesis can improve growth of Escherichia coli at low temperatures
査読有り
Daisuke Shiomi, Hironori Niki
MICROBIOLOGY AND IMMUNOLOGY55
(
12
)
885
-
888
2011年12月
-
Visualization of bacteriophage P1 infection by cryo-electron tomography of tiny Escherichia coli
査読有り
Jun Liu, Cheng-Yen Chen, Daisuke Shiomi, Hironori Niki, William Margolin
VIROLOGY417
(
2
)
304
-
311
2011年9月
-
Identification of Escherichia coli ZapC (YcbW) as a Component of the Division Apparatus That Binds and Bundles FtsZ Polymers
査読有り
Cynthia A. Hale, Daisuke Shiomi, Bing Liu, Thomas G. Bernhardt, William Margolin, Hironori Niki, Piet A. J. de Boer
JOURNAL OF BACTERIOLOGY193
(
6
)
1393
-
1404
2011年3月
-
細胞骨格タンパク質による大腸菌の形態形成機構
塩見 大輔, 仁木 宏典
日本微生物生態学会誌24
(
2
)
51
-
60
2009年9月1日
-
Genetic mechanism regulating bacterial cell shape and metabolism.
Shiomi D, Mori H, Niki H
2009年5月
-
Genetic mechanism regulating bacterial cell shape and metabolism
Daisuke Shiomi, Hideo Mori, Hironori Niki
Communicative and Integrative Biology2
(
3
)
219
-
220
2009年5月
-
Determination of bacterial rod shape by a novel cytoskeletal membrane protein
査読有り
Daisuke Shiomi, Masako Sakai, Hironori Niki
EMBO JOURNAL27
(
23
)
3081
-
3091
2008年12月
-
Compensation for the loss of the conserved membrane targeting sequence of FtsA provides new insights into its function
査読有り
Daisuke Shiomi, William Margolin
MOLECULAR MICROBIOLOGY67
(
3
)
558
-
569
2008年2月
-
大腸菌におけるタンパク質の細胞内局在とそのメカニズム
塩見大輔
生化学80
(
1
)
36
-
40
2008年1月25日
-
細菌の膜貫通型受容体の局在とそのメカニズム
塩見 大輔, 川岸 郁朗
生物物理48
(
1
)
30
-
34
2008年1月25日
-
[Mechanism underlying subcellular localization of proteins in Escherichia coli].
査読有り
Shiomi D
Seikagaku. The Journal of Japanese Biochemical Society80
36
-
40
2008年1月
-
Dimerization or oligomerization of the actin-like FtsA protein enhances the integrity of the cytokinetic Z ring
査読有り
Daisuke Shiomi, William Margolin
MOLECULAR MICROBIOLOGY66
(
6
)
1396
-
1415
2007年12月
-
A sweet sensor for size-conscious bacteria
査読有り
Daisuke Shiomi, William Margolin
CELL130
(
2
)
216
-
218
2007年7月
-
An altered FtsA can compensate for the loss of essential cell division protein FtsN in Escherichia coli
査読有り
Christophe S. Bernard, Mahalakshmi Sadasivam, Daisuke Shiomi, William Margolin
MOLECULAR MICROBIOLOGY64
(
5
)
1289
-
1305
2007年6月
-
The ftsA* gain-of-function allele of Escherichia coli and its effects on the stability and dynamics of the Z ring
査読有り
Brett Geissler, Daisuke Shiomi, William Margolin
MICROBIOLOGY-SGM153
(
3
)
814
-
825
2007年3月
-
The C-terminal domain of MinC inhibits assembly of the Z ring in Escherichia coli
査読有り
Daisuke Shiomi, William Margolin
JOURNAL OF BACTERIOLOGY189
(
1
)
236
-
243
2007年1月
-
Helical distribution of the bacterial chemoreceptor via colocalization with the Sec protein translocation machinery
査読有り
D Shiomi, M Yoshimoto, M Homma, Kawagishi, I
MOLECULAR MICROBIOLOGY60
(
4
)
894
-
906
2006年5月
-
2P547 Single cell based analysis on the polarity of Escherichia coli cells(52. Bio-imaging,Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)
Ayano Satoru, Inoue Ippei, Shiomi Daisuke, Kawagishi Ikuro, Yasuda Kenji
生物物理46
(
2
)
S432
2006年
-
Stabilization of polar localization of a chemoreceptor via its covalent modifications and its communication with a different chemoreceptor
査読有り
D Shiomi, S Banno, M Homma, Kawagishi, I
JOURNAL OF BACTERIOLOGY187
(
22
)
7647
-
7654
2005年11月
-
3P227 大腸菌全ヒスチジンキナーゼの細胞内局在(細胞生物的課題(接着・運動・骨格・伝達・膜)))
吉本 誠之, 塩見 大輔, 本間 道夫, 川岸 郁朗
生物物理45
S260
2005年
-
2P228 大腸菌酸化還元走性センサーAerの細胞内局在とクラスター形成機構の解析(細胞生物的課題(接着・運動・骨格・伝達・膜)))
太田 徳子, 坂野 聡美, 小幡 祐美, 塩見 大輔, 本間 道夫, 川岸 郁朗
生物物理45
S176
2005年
-
3P348 大腸菌の細胞分裂によって生じる極性の1細胞計測(その他))
綾野 賢, 井之上 一平, 塩見 大輔, 川岸 郁朗, 安田 賢二
生物物理45
S290
2005年
-
Targeting of the chemotaxis methylesterase/deamidase CheB to the polar receptor-kinase cluster in an Escherichia coli cell
査読有り
S Banno, D Shiomi, M Homma, Kawagishi, I
MOLECULAR MICROBIOLOGY53
(
4
)
1051
-
1063
2004年8月
-
Simultaneous measurement of sensor-protein dynamics and motility of a single cell by on-chip microcultivation system.
査読有り
国際誌
Ippei Inoue, Daisuke Shiomi, Ikuro Kawagishi, Kenji Yasuda
Journal of nanobiotechnology2
(
1
)
4
-
4
2004年4月30日
-
Attractant binding alters arrangement of chemoreceptor dimers within its cluster at a cell pole
査読有り
M Homma, D Shiomi, M Homma, Kawagishi, I
PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA101
(
10
)
3462
-
3467
2004年3月
-
3P213 化学刺激に対する大腸菌アスパラギン受容体の分子ダイナミクスと運動ダイナミクスの1細胞計測(化学受容)
井之上 一平, 塩見 大輔, 川岸 郁朗, 安田 賢二
生物物理44
S243
2004年
-
2P144 大腸菌酸化還元走性センサーAerの細胞内局在と走化性レセプターとの相互作用(細胞生物的課題 : 接着・運動・骨格・伝達・膜)
小幡 祐美, 塩見 大輔, 本間 道夫, 川岸 郁朗
生物物理44
S145
2004年
-
2P142 大腸菌走化性レセプターの極およびらせん状の局在メカニズム(細胞生物的課題 : 接着・運動・骨格・伝達・膜)
吉本 誠之, 塩見 大輔, 本間 道夫, 川岸 郁朗
生物物理44
S145
2004年
-
2P143 大腸菌走化性における受容体脱メチル化酵素CheBの局在を介した負のフィードバック制御(細胞生物的課題 : 接着・運動・骨格・伝達・膜)
坂野 聡美, 塩見 大輔, 本間 道夫, 川岸 郁朗
生物物理44
S145
2004年
-
オンチップ大腸菌-細胞培養系を用いた細胞内蛋白質ダイナミクスの計測
井之上 一平, 若本 祐一, 塩見 大輔, 川岸 郁朗, 安田 賢二
生物物理43
S243
2003年
-
大腸菌走化性レセプターの極へのターゲット機構の解析
塩見 大輔, 吉本 誠之, 入枝 泰樹, 本間 道夫, 川岸 郁朗
生物物理43
S106
2003年
-
大腸菌アスパラギン酸レセプターTarの極クラスターにおけるダイマー間相互作用とシグナル増幅
本間 幹啓, 塩見 大輔, 本間 道夫, 川岸 郁朗
生物物理43
S180
2003年
-
大腸菌酸化還元走性センサーAerの細胞内局在
小幡 祐美, 塩見 大輔, 本間 道夫, 川岸 郁朗
生物物理43
S153
2003年
-
脱メチル化酵素CheBによる走化性レセプター・キナーゼ複合体の認識機構
坂野 聡美, 塩見 大輔, 本間 道夫, 川岸 郁朗
生物物理43
S153
2003年
-
Dual recognition of the bacterial chemoreceptor by chemotaxis-specific domains of the CheR methyltransferase
査読有り
D Shiomi, IB Zhulin, M Homma, Kawagishi, I
JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY277
(
44
)
42325
-
42333
2002年11月
-
Intragenic suppressors of a mutation in the aspartate chemoreceptor gene that abolishes binding of the receptor to methyltransferase
査読有り
D Shiomi, M Homma, Kawagishi, I
MICROBIOLOGY-SGM148
3265
-
3275
2002年10月
-
1C0900 大腸菌細胞極における走化性レセプター・キナーゼ複合体形成の制御機構(14.化学受容,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)
塩見 大輔, 本間 道夫, 川岸 郁朗
生物物理42
(
2
)
S19
2002年
-
1C0915 大腸菌走化性に関与する脱メチル化酵素CheBの細胞内局在の解析(14.化学受容,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)
坂野 聡美, 塩見 大輔, 本間 道夫, 川岸 郁朗
生物物理42
(
2
)
S19
2002年
-
1C1000 コレラ菌のもつ3種のメチル化酵素CheRホモログの機能解析(14.化学受容,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)
百武 晃宏, 西岡 典子, 塩見 大輔, 本間 道夫, 川岸 郁朗
生物物理42
(
2
)
S20
2002年
-
1C0930 大腸菌走化性レセプターのダイマー間相互作用に対するメチル化と誘引物質の影響(14.化学受容,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)
本間 幹啓, 塩見 大輔, 本間 道夫, 川岸 郁朗
生物物理42
(
2
)
S20
2002年
-
2P169適応におけるメチル化の影響 : 走化性受容体のリガンド結合親和性と極局在の変化
坂本 博史, 塩見 大輔, 岩間 智徳, 本間 道夫, 川岸 郁朗
生物物理41
S138
2001年
-
2P168大腸菌走化性の適応過程におけるシグナル伝達タンパク質の細胞内局在
塩見 大輔, Igor Zhulin, 本間 道夫, 川岸 郁朗
生物物理41
S137
2001年
-
The aspartate chemoreceptor Tar is effectively methylated by binding to the methyltransferase mainly through hydrophobic interaction
査読有り
D Shiomi, H Okumura, M Homma, Kawagishi, I
MOLECULAR MICROBIOLOGY36
(
1
)
132
-
140
2000年4月
-
1L0930 大腸菌走化性のメチル基転移酵素CheRの機能解析
塩見 大輔, Zhulin Igor., 本間 道夫, 川岸 郁朗
生物物理40
S89
2000年
-
1PA079 細菌走化性レセプターとメチル基転移酵素の相互作用とその適応における役割
塩見 大輔, 降旗 達也, 佐藤 健, 本間 道夫, 川岸 郁朗
生物物理39
S53
1999年