2025/06/23 更新

写真b

シオミ　ダイスケ
塩見　大輔
SHIOMI Daisuke
*大学が定期的に情報更新している項目（その他は、researchmapの登録情報を転載）
所属*
理学部 生命理学科
理学研究科 生命理学専攻 博士課程後期課程
理学研究科 生命理学専攻 博士課程前期課程
職名*
教授
学位
博士（理学） （ 名古屋大学大学院理学研究科 ）
研究キーワード

  • L型細菌

  • タンパク質間相互作用

  • 細胞形態

  • 形態

  • Bacterial two-hybrid

  • 細胞極性

  • 好熱菌

  • 極性

  • 細胞長

  • 細胞幅

  • 再構成系

  • ペプチドグリカン

  • 大腸菌

  • 形態形成

  • 蛍光タンパク質

  • 抑圧変異体

  • 免疫染色

  • 微生物

  • 細胞膜

  • 細胞骨格タンパク質

  • 低温感受性

  • 細胞分裂

  • 次世代ゲノムシークエンス

  • 細胞骨格

  • 細胞生物学

    • 学内職務経歴*
    • 2020年4月 - 現在 
      理学部   生命理学科   教授
    • 2020年4月 - 現在 
      理学研究科   生命理学専攻 博士課程前期課程   教授
    • 2020年4月 - 現在 
      理学研究科   生命理学専攻 博士課程後期課程   教授
    • 2013年4月 - 2020年3月 
      理学部   生命理学科   准教授
    • 2013年4月 - 2020年3月 
      理学研究科   生命理学専攻 博士課程前期課程   准教授
    • 2013年4月 - 2020年3月 
      理学研究科   生命理学専攻 博士課程後期課程   准教授

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    研究分野

    • ライフサイエンス / 応用微生物学

    • ライフサイエンス / 細菌学

    • ライフサイエンス / 細胞生物学

    • ライフサイエンス / 分子生物学

    経歴

    • 2020年4月 - 現在 
      立教大学   理学部生命理学科   教授

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    • 2013年4月 - 現在 
      立教大学   理学部生命理学科   准教授

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    • 2008年1月 - 2013年3月 
      国立遺伝学研究所   研究員

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    • 2004年4月 - 2007年12月 
      テキサス大学   博士研究員

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    • 2002年10月 - 2004年3月 
      名古屋大学理学部   日本学術振興会特別研究員PD

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    • 2002年4月 - 2002年9月 
      名古屋大学大学院   理学研究科   生命理学専攻 DC2

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    学歴

    • 2000年4月 - 2002年9月 
      名古屋大学大学院   理学研究科   生命理学専攻 博士課程 後期

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    • 1998年4月 - 2000年3月 
      名古屋大学大学院   理学研究科   生命理学専攻 博士課程 前期

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    • 1994年4月 - 1998年3月 
      名古屋大学   理学部   分子生物学科

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    委員歴

    • 2024年1月 - 現在 
      日本ゲノム微生物学会   評議員

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      団体区分：学協会

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    • 2018年1月 - 2020年12月 
      日本ゲノム微生物学会   会計監査

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      団体区分：学協会

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    • 2018年1月 - 2020年12月 
      日本細菌学会   シンポジウム企画調整委員

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      団体区分：学協会

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    • 2015年1月 - 2017年12月 
      日本細菌学会   広報委員

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      団体区分：学協会

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    受賞

    • 2025年6月  
      第21回21世紀大腸菌研究会  ポスター発表優秀賞  必須遺伝子の発現抑制と大腸菌 L-form における必須性の検証
       
      尾澤 菜月 (M1)

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    • 2023年6月  
      第19回21世紀大腸菌研究会  口頭発表賞  大腸菌の桿菌-L-form 変換時におけるゲノム DNA の動態解析
       
      遠山 唯(M1)

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    • 2022年6月  
      第18回21世紀大腸菌研究会  口頭部門発表賞 
       
      山口 穂野香 (M2)

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    • 2021年8月  
      第17回21世紀大腸菌研究会  優秀発表賞（ポスター発表部門） 
       
      浪川結衣 (B4)

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    • 2021年3月  
      第15回日本ゲノム微生物学会年会  ポスター賞（優秀賞） 
       
      林匡史 (PD)

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    • 2021年3月  
      第15回日本ゲノム微生物学会年会  ポスター賞（優秀賞） 
       
      山口穂野香 (B4)

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    • 2020年10月  
      第103回日本細菌学会関東支部会  最優秀学生発表賞 
       
      近田大基 (M2)

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    • 2019年8月  
      第13回細菌学若手コロッセウム  優秀発表賞 
       
      阿合理沙 (M2)

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    • 2019年5月  
      第16回21世紀大腸菌研究会優秀口頭発表賞 
       
      近田大基 (M1)

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    • 2018年11月  
      第101回 日本細菌学会関東支部総会  学生優秀発表賞 
       
      阿合理沙 (M1)

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    • 2018年5月  
      第15回 21世紀大腸菌研究会  優秀口頭発表賞 
       
      阿合理沙 (M1)

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    • 2014年3月  
      日本細菌学会  黒屋奨学賞  細菌形態形成制御機構に関する研究
       
      塩見 大輔

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    論文

    • Spiroplasma eriocheiris FtsZ assembles the ring-like structure assisted by SepF. 査読有り 国際誌

      Taishi Kasai, Yuhei O Tahara, Makoto Miyata, Daisuke Shiomi

      The Journal of biological chemistry   108373 - 108373   2025年3月3日

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      担当区分：責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

      The FtsZ protein is involved in bacterial cell division. In cell-walled bacteria, such as Bacillus subtilis, FtsZ forms a ring-like structure, called the Z ring, at the cell division site and acts as a scaffold for cell wall synthesis. The inhibition of cell wall synthesis in B. subtilis has been shown to interfere with the function of the Z ring, causing a loss in cell division control. Spiroplasma, a cell wall-less bacterium, lacks most of the genes involved in cell division; however, the ftsZ gene remains conserved. The function of Spiroplasma eriocheiris FtsZ (SeFtsZ) remains to be determined. In the present study, we analyzed the biochemical characteristics of SeFtsZ. Purified SeFtsZ demonstrated lower polymerization capacity and GTPase activity than FtsZ from Escherichia coli and B. subtilis. We also investigated the relationship between SeFtsZ and SeSepF, which anchors FtsZ to the cell membrane, and found that SeSepF did not contribute to the stability of FtsZ filaments, unlike the B. subtilis SepF. SeFtsZ and SeSepF were produced in E. coli L-forms, where cell wall synthesis was inhibited. SeFtsZ formed ring-like structures in cell wall-less E. coli cells, suggesting that SeFtsZ forms Z rings and is involved in cell division independently of cell wall synthesis.

      DOI： 10.1016/j.jbc.2025.108373

      PubMed

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    • Septal wall synthesis is sufficient to change ameba-like cells into uniform oval-shaped cells in Escherichia coli L-forms. 査読有り 国際誌

      Masafumi Hayashi, Chigusa Takaoka, Koichi Higashi, Ken Kurokawa, William Margolin, Taku Oshima, Daisuke Shiomi

      Communications biology7 ( 1 ) 1569   2024年11月26日

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      担当区分：責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

      A cell wall is required to control cell shape and size to maintain growth and division. However, some bacterial species maintain their morphology and size without a cell wall, calling into question the importance of the cell wall to maintain shape and size. It has been very difficult to examine the dispensability of cell wall synthesis in rod-shaped bacteria such as Escherichia coli for maintenance of their shape and size because they lyse without cell walls under normal culture conditions. Here, we show that wall-less E. coli L-form cells, which have a heterogeneous cell morphology, can be converted to a mostly uniform oval shape solely by FtsZ-dependent division, even in the absence of cylindrical cell wall synthesis. This FtsZ-dependent control of cell shape and size in the absence of a cell wall requires at least either the Min or nucleoid occlusion systems for positioning FtsZ at mid cell division sites.

      DOI： 10.1038/s42003-024-07279-y

      PubMed

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    • 細菌の新奇生存戦略:L-form 細胞壁が有っても無くても細菌は生きられる 招待有り

      塩見大輔, 林匡史, 大島拓

      化学と生物62 ( 1 )   2024年1月1日

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      担当区分：筆頭著者   記述言語：日本語  

      J-GLOBAL

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    • Relationship between the Rod complex and peptidoglycan structure in Escherichia coli 査読有り

      Risa Ago, Yuhei O. Tahara, Honoka Yamaguchi, Motoya Saito, Wakana Ito, Kaito Yamasaki, Taishi Kasai, Sho Okamoto, Taiki Chikada, Taku Oshima, Issey Osaka, Makoto Miyata, Hironori Niki, Daisuke Shiomi

      MicrobiologyOpen12 ( 5 )   2023年10月9日

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      担当区分：責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

      DOI： 10.1002/mbo3.1385

      Scopus

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    • D-amino Acids Ameliorate Experimental Colitis and Cholangitis by Inhibiting Growth of Proteobacteria: Potential Therapeutic Role in Inflammatory Bowel Disease. 査読有り 国際誌

      Satoko Umeda, Tomohisa Sujino, Kentaro Miyamoto, Yusuke Yoshimatsu, Yosuke Harada, Keita Nishiyama, Yoshimasa Aoto, Keika Adachi, Naoki Hayashi, Kimiko Amafuji, Nobuko Moritoki, Shinsuke Shibata, Nobuo Sasaki, Masashi Mita, Shun Tanemoto, Keiko Ono, Yohei Mikami, Jumpei Sasabe, Kaoru Takabayashi, Naoki Hosoe, Toshihiko Suzuki, Toshiro Sato, Koji Atarashi, Toshiaki Teratani, Haruhiko Ogata, Nobuhiro Nakamoto, Daisuke Shiomi, Hiroshi Ashida, Takanori Kanai

      Cellular and molecular gastroenterology and hepatology   2023年8月9日

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      記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

      BACKGROUND & AIMS: D-amino acids, the chiral counterparts of protein L-amino acids, were primarily produced and utilized by microbes, including those in the human gut. However, little was known about how orally administered or microbe-derived D-amino acids affected the gut microbial community or gut disease progression. METHODS: The ratio of D- to L-amino acids was analysed in feces and blood from patients with ulcerative colitis (UC) and healthy controls. Also, composition of microbe was analysed from patients with UC. Mice treated with D- amino acid in DSS colitis model and liver cholangitis model. RESULTS: The ratio of D- to L-amino acids was lower in the feces of patients with UC than that of healthy controls. Supplementation of D-amino acids ameliorated UC-related experimental colitis and liver cholangitis by inhibiting growth of Proteobacteria. Addition of D-alanine, a major building block for bacterial cell wall formation, to culture medium inhibited expression of the ftsZ gene required for cell fission in the Proteobacteria Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae, thereby inhibiting growth. Overexpression of ftsZ restored growth of E. coli even when D-alanine was present. We found that D-alanine not only inhibited invasion of pathological K. pneumoniae into the host via pore formation in intestinal epithelial cells but also inhibited growth of E. coli and generation of antibiotic-resistant strains. CONCLUSION: D-aa might have potential for use in novel therapeutic approaches targeting Proteobacteria-associated dysbiosis and antibiotic-resistant bacterial diseases by means of their effects on the intestinal microbiota community.

      DOI： 10.1016/j.jcmgh.2023.08.002

      PubMed

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    • 大腸菌 L-formの増殖における外膜の重要性 招待有り 査読有り

      塩見大輔, 大島拓

      生物物理誌63 ( 1 ) 27 - 29   2023年1月

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      担当区分：筆頭著者,　責任著者   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

      DOI： 10.2142/biophys.63.27

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    • 壁をなくしてみたところ 招待有り 査読有り

      大島 拓, 塩見 大輔

      生物工学会誌100 ( 3 ) 137 - 137   2022年3月

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      担当区分：最終著者  

      DOI： 10.34565/seibutsukogaku.100.3_1

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    • Direct Observation of Conversion From Walled Cells to Wall-Deficient L-Form and Vice Versa in Escherichia coli Indicates the Essentiality of the Outer Membrane for Proliferation of L-Form Cells. 査読有り 国際誌

      Taiki Chikada, Tomomi Kanai, Masafumi Hayashi, Taishi Kasai, Taku Oshima, Daisuke Shiomi

      Frontiers in microbiology12   645965 - 645965   2021年3月

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      担当区分：責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

      Gram-negative bacteria such as Escherichia coli are surrounded by an outer membrane, which encloses a peptidoglycan layer. Even if thinner than in many Gram-positive bacteria, the peptidoglycan in E. coli allows cells to withstand turgor pressure in hypotonic medium. In hypertonic medium, E. coli treated with a cell wall synthesis inhibitor such as penicillin G form wall-deficient cells. These so-called L-form cells grow well under anaerobic conditions (i.e., in the absence of oxidative stress), becoming deformed and dividing as L-form. Upon removal of the inhibitor, they return to the walled rod-shaped state. Recently, the outer membrane was reported to provide rigidity to Gram-negative bacteria and to strengthen wall-deficient cells. However, it remains unclear why L-form cells need the outer membrane for growth. Using a microfluidic system, we found that, upon treatment with the outer membrane-disrupting drugs polymyxin B and polymyxin B nonapeptide or with the outer membrane synthesis inhibitor CHIR-090, the cells lysed during cell deformation and division, indicating that the outer membrane was important even in hypertonic medium. L-form cells could return to rod-shaped when trapped in a narrow space, but not in a wide space, likely due to insufficient physical force. Outer membrane rigidity could be compromised by lack of outer membrane proteins; Lpp, OmpA, or Pal. Deletion of lpp caused cells to lyse during cell deformation and cell division. In contrast, ompA and pal mutants could be deformed and return to small oval cells even when less physical force was exerted. These results strongly suggest that wall-deficient E. coli cells require a rigid outer membrane to survive, but not too rigid to prevent them from changing cell shape.

      DOI： 10.3389/fmicb.2021.645965

      PubMed

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    • Alteration of Membrane Fluidity or Phospholipid Composition Perturbs Rotation of MreB Complexes in Escherichia coli. 査読有り 国際誌

      Keisuke Kurita, Fumiya Kato, Daisuke Shiomi

      Frontiers in molecular biosciences7   582660 - 582660   2020年

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      担当区分：責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

      Gram-negative bacteria such as Escherichia coli are surrounded by inner and outer membranes and peptidoglycan in between, protecting the cells from turgor pressure and maintaining cell shape. The Rod complex, which synthesizes peptidoglycan, is composed of various proteins such as a cytoplasmic protein MreB, a transmembrane protein RodZ, and a transpeptidase PBP2. The Rod complex is a highly motile complex that rotates around the long axis of a cell. Previously, we had reported that anionic phospholipids (aPLs; phosphatidylglycerol and cardiolipin) play a role in the localization of MreB. In this study, we identified that cells lacking aPLs slow down Rod complex movement. We also found that at higher temperatures, the speed of movement increased in cells lacking aPLs, suggesting that membrane fluidity is important for movement. Consistent with this idea, Rod complex motion was reduced, and complex formation was disturbed in the cells depleted of FabA or FabB, which are essential for unsaturated fatty acid synthesis. These cells also showed abnormal morphology. Therefore, membrane fluidity is important for maintaining cell shape through the regulation of Rod complex formation and motility.

      DOI： 10.3389/fmolb.2020.582660

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    • RodZ: A key-player in cell elongation and cell division in Escherichia coli 招待有り 査読有り 国際誌

      Risa Ago, Daisuke Shiomi

      AIMS Microbiology5 ( 4 ) 358 - 367   2019年11月

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      担当区分：責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

      DOI： 10.3934/microbiol.2019.4.358

      Scopus

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    • Division-site localization of RodZ is required for efficient Z ring formation in Escherichia coli. 査読有り 国際誌

      Yoshii Y, Niki H, Shiomi D

      Molecular microbiology111 ( 5 ) 1229 - 1244   2019年5月

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      担当区分：責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

      DOI： 10.1111/mmi.14217

      PubMed

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    • Relation between rotation of MreB actin and cell width of Escherichia coli. 査読有り 国際誌

      Kurita K, Shin R, Tabei T, Shiomi D

      Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms24 ( 3 ) 259 - 265   2019年3月

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      担当区分：責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

      DOI： 10.1111/gtc.12667

      PubMed

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    • MreBアクチンの細胞内局在と機能の制御機構

      栗田恵輔, 塩見大輔

      生物物理(Web)59 ( 2 ) 100‐102(J‐STAGE)   2019年

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      記述言語：日本語  

      DOI： 10.2142/biophys.59.100

      J-GLOBAL

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    • The periplasmic disordered domain of RodZ promotes its self-interaction in Escherichia coli 査読有り 国際誌

      Ryosuke Ikebe, Yuri Kuwabara, Taiki Chikada, Hironori Niki, Daisuke Shiomi

      Genes to Cells23 ( 4 ) 307 - 317   2018年4月1日

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      担当区分：責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Blackwell Publishing Ltd  

      DOI： 10.1111/gtc.12572

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    • Erratum: Author Correction: ARC6-mediated Z ring-like structure formation of prokaryote-descended chloroplast FtsZ in Escherichia coli (Scientific reports (2017) 7 1 (3492))

      Hiroki Irieda, Daisuke Shiomi

      Scientific reports8 ( 1 ) 4876   2018年3月15日

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      記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：NLM (Medline)  

      DOI： 10.1038/s41598-018-23160-5

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    • Bacterial heterologous expression system for reconstitution of chloroplast inner division ring and evaluation of its contributors 査読有り 国際誌

      Hiroki Irieda, Daisuke Shiomi

      International Journal of Molecular Sciences19 ( 2 )   2018年2月11日

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      記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：MDPI AG  

      DOI： 10.3390/ijms19020544

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    • Polar localization of MreB actin is inhibited by anionic phospholipids in the rod-shaped bacterium Escherichia coli (vol 63, pg 849, 2017) 招待有り 査読有り

      Daisuke Shiomi

      CURRENT GENETICS63 ( 5 ) 845 - 848   2017年10月

      ▶ 詳細を見る

      担当区分：責任著者   記述言語：英語  

      DOI： 10.1007/s00294-017-0701-z

      PubMed

      researchmap

    • ARC6-mediated Z ring-like structure formation of prokaryote-descended chloroplast FtsZ in Escherichia coli 査読有り

      Hiroki Irieda, Daisuke Shiomi

      SCIENTIFIC REPORTS7 ( 1 ) 3492   2017年6月

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      担当区分：責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

      DOI： 10.1038/s41598-017-03698-6

      PubMed

      researchmap

    • Exclusion of assembled MreB by anionic phospholipids at cell poles confers cell polarity for bidirectional growth 査読有り

      Takuma Kawazura, Kanon Matsumoto, Koki Kojima, Fumiya Kato, Tomomi Kanai, Hironori Niki, Daisuke Shiomi

      MOLECULAR MICROBIOLOGY104 ( 3 ) 472 - 486   2017年5月

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      担当区分：責任著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

      DOI： 10.1111/mmi.13639

      PubMed

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    • Rapid, precise quantification of bacterial cellular dimensions across a genomic-scale knockout library 査読有り

      Tristan Ursell, Timothy K. Lee, Daisuke Shiomi, Handuo Shi, Carolina Tropini, Russell D. Monds, Alexandre Colavin, Gabriel Billings, Ilina Bhaya-Grossman, Michael Broxton, Bevan Emma Huang, Hironori Niki, Kerwyn Casey Huang

      BMC BIOLOGY15 ( 1 ) 17   2017年2月

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      記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

      DOI： 10.1186/s12915-017-0348-8

      PubMed

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    • Regulation of bacterial cell shape revealed by single cell observations 招待有り

      Daisuke Shiomi

      Microscopy65   i9 - i9   2016年

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      記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：Oxford University Press  

      DOI： 10.1093/jmicro/dfw044

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    • [Regulation of determination of bacterial shape]. 査読有り

      Shiomi D

      Nihon saikingaku zasshi. Japanese journal of bacteriology69 ( 4 ) 557 - 564   2014年

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      記述言語：日本語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

      DOI： 10.3412/jsb.69.557

      PubMed

      J-GLOBAL

      researchmap

    • A mutation in the promoter region of zipA, a component of the divisome, suppresses the shape defect of RodZ-deficient cells 査読有り

      Daisuke Shiomi, Hironori Niki

      MICROBIOLOGYOPEN2 ( 5 ) 798 - 810   2013年10月

      ▶ 詳細を見る

      担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

      DOI： 10.1002/mbo3.116

      PubMed

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    • Mutations in cell elongation genes mreB, mrdA and mrdB suppress the shape defect of RodZ-deficient cells 査読有り

      Daisuke Shiomi, Atsushi Toyoda, Tomoyuki Aizu, Fumio Ejima, Asao Fujiyama, Tadasu Shini, Yuji Kohara, Hironori Niki

      MOLECULAR MICROBIOLOGY87 ( 5 ) 1029 - 1044   2013年3月

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      担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

      DOI： 10.1111/mmi.12148

      PubMed

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    • A mutation of ispA that is involved in isoprenoid biogenesis can improve growth of Escherichia coli at low temperatures 査読有り

      Daisuke Shiomi, Hironori Niki

      MICROBIOLOGY AND IMMUNOLOGY55 ( 12 ) 885 - 888   2011年12月

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      担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

      DOI： 10.1111/j.1348-0421.2011.00391.x

      PubMed

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    • Visualization of bacteriophage P1 infection by cryo-electron tomography of tiny Escherichia coli 査読有り

      Jun Liu, Cheng-Yen Chen, Daisuke Shiomi, Hironori Niki, William Margolin

      VIROLOGY417 ( 2 ) 304 - 311   2011年9月

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      記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

      DOI： 10.1016/j.virol.2011.06.005

      PubMed

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    • Identification of Escherichia coli ZapC (YcbW) as a Component of the Division Apparatus That Binds and Bundles FtsZ Polymers 査読有り

      Cynthia A. Hale, Daisuke Shiomi, Bing Liu, Thomas G. Bernhardt, William Margolin, Hironori Niki, Piet A. J. de Boer

      JOURNAL OF BACTERIOLOGY193 ( 6 ) 1393 - 1404   2011年3月

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      記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

      DOI： 10.1128/JB.01245-10

      PubMed

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    • 細胞骨格タンパク質による大腸菌の形態形成機構

      塩見 大輔, 仁木 宏典

      日本微生物生態学会誌24 ( 2 ) 51 - 60   2009年9月1日

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      記述言語：日本語   出版者・発行元：日本微生物生態学会  

      DOI： 10.20709/jsmeja.24.2_51

      CiNii Article

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    • Genetic mechanism regulating bacterial cell shape and metabolism

      Daisuke Shiomi, Hideo Mori, Hironori Niki

      Communicative and Integrative Biology2 ( 3 ) 219 - 220   2009年5月

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      担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

      DOI： 10.4161/cib.2.3.7930

      Scopus

      PubMed

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    • Determination of bacterial rod shape by a novel cytoskeletal membrane protein 査読有り

      Daisuke Shiomi, Masako Sakai, Hironori Niki

      EMBO JOURNAL27 ( 23 ) 3081 - 3091   2008年12月

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      担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

      DOI： 10.1038/emboj.2008.234

      PubMed

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    • Compensation for the loss of the conserved membrane targeting sequence of FtsA provides new insights into its function 査読有り

      Daisuke Shiomi, William Margolin

      MOLECULAR MICROBIOLOGY67 ( 3 ) 558 - 569   2008年2月

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      担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

      DOI： 10.1111/j.1365-2958.2007.06085.x

      PubMed

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    • 大腸菌におけるタンパク質の細胞内局在とそのメカニズム

      塩見大輔

      生化学80 ( 1 ) 36 - 40   2008年1月25日

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      記述言語：日本語   出版者・発行元：日本生化学会  

      CiNii Article

      J-GLOBAL

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    • 細菌の膜貫通型受容体の局在とそのメカニズム

      塩見 大輔, 川岸 郁朗

      生物物理48 ( 1 ) 30 - 34   2008年1月25日

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      記述言語：日本語   出版者・発行元：日本生物物理学会  

      The chemoreceptors of Escherichia coli cluster at a cell pole, a property which is critical for signaling. However, little is known about the mechanism of polar localization. Our recent study demonstrated that the aspartate chemoreceptor (Tar)-GFP fusion protein is inserted into lateral membrane regions and migrates to the pole. Unexpectedly, Tar-GFP was found to be arranged into a coil, which reflects a coil of the Sec protein translocation machinery. The Sec coil appeared distinct from the coil of MreB, an actin-like cytoskeletal protein. These findings shed new light on the spatial organ...

      DOI： 10.2142/biophys.48.030

      CiNii Article

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    • [Mechanism underlying subcellular localization of proteins in Escherichia coli]. 査読有り

      Shiomi D

      Seikagaku. The Journal of Japanese Biochemical Society80   36 - 40   2008年1月

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      掲載種別：研究論文（学術雑誌）   出版者・発行元：1  

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    • Dimerization or oligomerization of the actin-like FtsA protein enhances the integrity of the cytokinetic Z ring 査読有り

      Daisuke Shiomi, William Margolin

      MOLECULAR MICROBIOLOGY66 ( 6 ) 1396 - 1415   2007年12月

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      担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

      DOI： 10.1111/j.1365-2958.2007.05998.x

      PubMed

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    • A sweet sensor for size-conscious bacteria 査読有り

      Daisuke Shiomi, William Margolin

      CELL130 ( 2 ) 216 - 218   2007年7月

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    • An altered FtsA can compensate for the loss of essential cell division protein FtsN in Escherichia coli 査読有り

      Christophe S. Bernard, Mahalakshmi Sadasivam, Daisuke Shiomi, William Margolin

      MOLECULAR MICROBIOLOGY64 ( 5 ) 1289 - 1305   2007年6月

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      記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

      DOI： 10.1111/j.1365-2958.2007.05738.x

      PubMed

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    • The ftsA* gain-of-function allele of Escherichia coli and its effects on the stability and dynamics of the Z ring 査読有り

      Brett Geissler, Daisuke Shiomi, William Margolin

      MICROBIOLOGY-SGM153 ( 3 ) 814 - 825   2007年3月

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      記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

      DOI： 10.1099/mic.0.2006/001834-0

      PubMed

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    • The C-terminal domain of MinC inhibits assembly of the Z ring in Escherichia coli 査読有り

      Daisuke Shiomi, William Margolin

      JOURNAL OF BACTERIOLOGY189 ( 1 ) 236 - 243   2007年1月

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      担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

      DOI： 10.1128/JB.00666-06

      PubMed

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    • Helical distribution of the bacterial chemoreceptor via colocalization with the Sec protein translocation machinery 査読有り

      D Shiomi, M Yoshimoto, M Homma, Kawagishi, I

      MOLECULAR MICROBIOLOGY60 ( 4 ) 894 - 906   2006年5月

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      担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

      DOI： 10.1111/j.1365-2958.2006.05145.x

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    • Stabilization of polar localization of a chemoreceptor via its covalent modifications and its communication with a different chemoreceptor 査読有り

      D Shiomi, S Banno, M Homma, Kawagishi, I

      JOURNAL OF BACTERIOLOGY187 ( 22 ) 7647 - 7654   2005年11月

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      担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

      DOI： 10.1128/JB.187.22.7647-7654.2005

      PubMed

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    • Targeting of the chemotaxis methylesterase/deamidase CheB to the polar receptor-kinase cluster in an Escherichia coli cell 査読有り

      S Banno, D Shiomi, M Homma, Kawagishi, I

      MOLECULAR MICROBIOLOGY53 ( 4 ) 1051 - 1063   2004年8月

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      記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

      DOI： 10.1111/j.1365-2958.2004.04176.x

      PubMed

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    • Simultaneous measurement of sensor-protein dynamics and motility of a single cell by on-chip microcultivation system. 査読有り 国際誌

      Ippei Inoue, Daisuke Shiomi, Ikuro Kawagishi, Kenji Yasuda

      Journal of nanobiotechnology2 ( 1 ) 4 - 4   2004年4月30日

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      記述言語：英語   出版者・発行元：1  

      Measurement of the correlation between sensor-protein expression, motility and environmental change is important for understanding the adaptation process of cells during their change of generation. We have developed a novel assay exploiting the on-chip cultivation system, which enabled us to observe the change of the localization of expressed sensor-protein and the motility for generations. Localization of the aspartate sensitive sensor protein at two poles in Escherichia coli decreased quickly after the aspartate was added into the cultivation medium. However, it took more than three generations for recovering the localization after the removal of aspartate from the medium. Moreover, the tumbling frequency was strongly related to the localization of the sensor protein in a cell. The results indicate that the change of the spatial localization of sensor protein, which was inherited for more than three generations, may contribute to cells, motility as the inheritable information.

      DOI： 10.1186/1477-3155-2-4

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    • Attractant binding alters arrangement of chemoreceptor dimers within its cluster at a cell pole 査読有り

      M Homma, D Shiomi, M Homma, Kawagishi, I

      PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA101 ( 10 ) 3462 - 3467   2004年3月

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      記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

      DOI： 10.1073/pnas.0306660101

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    • Dual recognition of the bacterial chemoreceptor by chemotaxis-specific domains of the CheR methyltransferase 査読有り

      D Shiomi, IB Zhulin, M Homma, Kawagishi, I

      JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY277 ( 44 ) 42325 - 42333   2002年11月

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      担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

      DOI： 10.1074/jbc.M202001200

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    • Intragenic suppressors of a mutation in the aspartate chemoreceptor gene that abolishes binding of the receptor to methyltransferase 査読有り

      D Shiomi, M Homma, Kawagishi, I

      MICROBIOLOGY-SGM148   3265 - 3275   2002年10月

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      担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

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    • The aspartate chemoreceptor Tar is effectively methylated by binding to the methyltransferase mainly through hydrophobic interaction 査読有り

      D Shiomi, H Okumura, M Homma, Kawagishi, I

      MOLECULAR MICROBIOLOGY36 ( 1 ) 132 - 140   2000年4月

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      担当区分：筆頭著者   記述言語：英語   掲載種別：研究論文（学術雑誌）  

      DOI： 10.1046/j.1365-2958.2000.01834.x

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    MISC

    • 大腸菌走化性レセプターの適応に重要なメチル化酵素結合部位の解析

      塩見 大輔, 奥村 尚, 本間 道夫, 川岸 郁朗

      日本味と匂学会誌 = The Japanese journal of taste and smell research5 ( 3 ) 527 - 528   1998年12月1日

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      記述言語：日本語   出版者・発行元：日本味と匂学会  

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    • 走化性レセプターにおけるメチル基転移酵素系結合配列の変異導入による解析

      塩見 大輔, 奥村 尚, 本間 道夫, 川岸 郁朗

      生物物理38 ( 2 ) S185   1998年9月7日

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      記述言語：日本語   出版者・発行元：一般社団法人日本生物物理学会  

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    講演・口頭発表等

    • 大腸菌 L-form の増殖に関わる機能未知タンパク質 YobH の機能の解明

      西川 芽衣亜, 鳥居 晃, 田原 悠平, 小山田 莉子, 宮田 真人, 大島 拓, 塩見 大輔

      第21回21世紀大腸菌研究会  2025年6月12日 

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      開催年月日： 2025年6月12日 - 2025年6月13日

      記述言語：日本語  

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    • 大腸菌の mlaC 遺伝子欠損による外膜小胞放出と L-form の関連性

      難波 千夢, 大島 拓, 塩見 大輔

      第21回21世紀大腸菌研究会  2025年6月12日 

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      開催年月日： 2025年6月12日 - 2025年6月13日

      記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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    • 大腸菌 L-form における RapA の欠損がもたらす影響

      小松 泰士, 角田 恵太郎, 大島 拓, 塩見 大輔

      第21回21世紀大腸菌研究会  2025年6月12日 

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      開催年月日： 2025年6月12日 - 2025年6月13日

      記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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    • 必須遺伝子の発現抑制と大腸菌 L-form における必須性の検証

      尾澤 菜月, 杉本 竜太, 石田 一紗, 大塚 香乃, 大島 拓, 塩見 大輔

      第21回21世紀大腸菌研究会  2025年6月12日 

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      開催年月日： 2025年6月12日 - 2025年6月13日

      記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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    • ミニマルセルを用いた細胞分裂装置形成に必要な最小因子の研究 招待有り

      清水大輝, 吉永芳佳, 林匡史, 塩見大輔

      第52回日本マイコプラズマ学会学術集会  2025年5月24日 

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      開催年月日： 2025年5月23日 - 2025年5月24日

      記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（招待・特別）  

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    • ペニシリンによる細胞壁代謝異常は呼吸の亢進を介して細胞壁を必要としない大腸菌L-formの生育を妨げる

      斉藤 元弥, 伊藤 わかな, 近田 大基, 塩見 大輔, 大島 拓

      第19回日本ゲノム微生物学会年会  2025年3月17日 

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      開催年月日： 2025年3月17日 - 2025年3月19日

      記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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    • 古くて新しいバクテリアの薬剤耐性状態L-formについて 招待有り

      塩見大輔

      宮崎大学医学部セミナー  2025年2月27日 

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      記述言語：日本語   会議種別：公開講演，セミナー，チュートリアル，講習，講義等  

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    • 最小ゲノムを持つ細菌を用いたFtsZの局在解析

      清水大輝, 林匡史, 佐藤彩翔, 塩見大輔

      第107回日本細菌学会関東支部総会  2024年12月14日 

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      開催年月日： 2024年12月14日

      記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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    • ハロプラズマの細胞分裂タンパク質FtsZの生化学的解析

      藤田寛興, 笠井大司, 塩見大輔

      第97回日本細菌学会総会  2024年8月8日 

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      開催年月日： 2024年8月7日 - 2024年8月9日

      記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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    • 最小ゲノムを持つバクテリアにおけるFtsZの細胞内局在の解析

      清水大輝, 林匡史, 塩見大輔

      第97回日本細菌学会総会  2024年8月7日 

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      開催年月日： 2024年8月7日 - 2024年8月9日

      記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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    • JCVI-syn3.0でのハロプラズマ細胞壁の構築

      笠井大司, 加藤真悟, 塩見大輔

      第97回日本細菌学会総会  2024年8月7日 

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      開催年月日： 2024年8月7日 - 2024年8月9日

      記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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    • 大腸菌の L-form への変換及び桿菌復帰時におけるゲノム DNA の動態

      遠山唯, 浪川結衣, 大島拓, 塩見大輔

      第20回21世紀大腸菌研究会  2024年6月17日 

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      開催年月日： 2024年6月17日 - 2024年6月18日

      記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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    • Septal cell wall synthesis is sufficient to change amoeba-like morphology to oval cell shape in Escherichia coli L-form cells.

      Masafumi Hayashi, Chigusa Takaoka, Koichi Higashi, Ken Kurokawa, William Margolin, Taku Oshima, Daisuke Shiomi

      EMBO workshop "Archaeal and bacterial cell division, Beyond the Z-ring"  2024年5月15日 

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      開催年月日： 2024年5月14日 - 2024年5月17日

      記述言語：英語   会議種別：ポスター発表  

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    • バクテリアの増殖にとって細胞壁は必要？不必要？ 招待有り

      塩見大輔

      大隅財団 微生物コンソーシアム定例会  2024年4月4日 

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      開催年月日： 2024年4月4日 - 2024年4月4日

      記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（招待・特別）  

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    • 人工細菌を用いたハロプラズマ細胞壁の再構築

      笠井大司, 田原悠平, 水谷雅希, 柿澤茂行, 宮田真人, 加藤真悟, 塩見大輔

      2023年度国立遺伝学研究所研究会「微生物の細胞複製システムから紐解く生命のデザイン」  2024年3月29日 

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      開催年月日： 2024年3月28日 - 2024年3月29日

      記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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    • バクテリアの未知の生存形態：L-form 招待有り

      塩見大輔

      生物の基礎探究会  2024年3月18日 

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      開催年月日： 2024年3月18日 - 2024年3月19日

      記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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    • ハロプラズマのDCWクラスターを中心とした細胞壁合成遺伝子の解析

      笠井大司, 加藤真悟, 塩見大輔

      第18回日本ゲノム微生物学会年会  2024年3月12日 

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      開催年月日： 2024年3月12日 - 2024年3月14日

      記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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    • 大腸菌の桿菌-L-form 変換時におけるゲノム DNA の動態解析

      遠山唯, 浪川結衣, 大島拓, 塩見大輔

      第19回21世紀大腸菌研究会  2023年6月30日 

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      開催年月日： 2023年6月29日 - 2023年6月30日

      会議種別：口頭発表（一般）  

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    • 機能未知遺伝子yobHのL-form増殖への影響

      鳥居晃, 小山田莉子, 大島拓, 塩見大輔

      第19回21世紀大腸菌研究会  2023年6月29日 

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      開催年月日： 2023年6月29日 - 2023年6月30日

      会議種別：ポスター発表  

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    • 大腸菌を用いた二重膜細胞から一重膜細胞への進化の過程の再現

      阿蒜侑佳, 近田大基, 大島拓, 塩見大輔

      第19回21世紀大腸菌研究会  2023年6月29日 

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      開催年月日： 2023年6月29日 - 2023年6月30日

      会議種別：ポスター発表  

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    • 細胞分裂の位置決定メカニズムが細胞の形を制御する

      林匡史, 高岡ちぐさ, 東光一, 黒川顕, 大島拓, 塩見大輔

      第19回21世紀大腸菌研究会  2023年6月29日 

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      開催年月日： 2023年6月29日 - 2023年6月30日

      会議種別：ポスター発表  

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    • 細胞壁を持たない細菌の細胞分裂タンパク質[DS1] を用いたL型大腸菌の分裂制御

      笠井大司, 田原悠平, 宮田真人, 塩見大輔

      第19回21世紀大腸菌研究会  2023年6月29日 

      ▶ 詳細を見る

      開催年月日： 2023年6月29日 - 2023年6月30日

      会議種別：ポスター発表  

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    • 大腸菌細胞壁修復に関わるSanAタンパク質の解析

      山口穂野香, 阿合理沙, 田原悠平, 笠井大司, 宮田真人, 塩見大輔

      2022年度国立遺伝学研究所研究会  2023年3月30日 

      ▶ 詳細を見る

      開催年月日： 2023年3月30日 - 2023年3月31日

      記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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    • 細胞壁のない細菌の細胞分裂タンパク質の相互作用解析

      笠井 大司, 田原 悠平, 宮田 真人, 塩見 大輔

      第96回日本細菌学会総会  2023年3月17日 

      ▶ 詳細を見る

      開催年月日： 2023年3月16日 - 2023年3月18日

      記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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    • FtsZ 依存的な細胞分裂による細胞サイズ制御

      林 匡史, 高岡 ちぐさ, 大島 拓, 塩見 大輔

      第17回日本ゲノム微生物学会年会  2023年3月10日 

      ▶ 詳細を見る

      開催年月日： 2023年3月8日 - 2023年3月10日

      記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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    • 大腸菌ペプチドグリカン修復関連因子の複合体構造予測と相互作用解析

      山口 穂野香, 阿合 理沙, 田原 悠平, 笠井 大司, 宮田 真人, 塩見 大輔

      第17回日本ゲノム微生物学会年会  2023年3月8日 

      ▶ 詳細を見る

      開催年月日： 2023年3月8日 - 2023年3月10日

      記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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    • 細胞壁を持たない大腸菌L-formにおけるゲノムDNAの動態解析

      遠山 唯, 浪川 結衣, 大島 拓, 塩見 大輔

      第17回日本ゲノム微生物学会年会  2023年3月8日 

      ▶ 詳細を見る

      開催年月日： 2023年3月8日 - 2023年3月10日

      記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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    • スパイロプラズマのFtsZタンパク質が構築する構造のL型大腸菌を用いた解析

      笠井 大司, 田原 悠平, 宮田 真人, 塩見 大輔

      第17回日本ゲノム微生物学会年会  2023年3月8日 

      ▶ 詳細を見る

      開催年月日： 2023年3月8日 - 2023年3月10日

      記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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    • バクテリアの生存戦略：バクテリアは細胞壁無しでどのように生存できるのか？ 招待有り

      塩見大輔

      大分大学グローカル感染症研究センター セミナー  2022年12月16日 

      ▶ 詳細を見る

      記述言語：日本語  

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    • 細胞壁に覆われていない大腸菌が見せる特異な表情 招待有り

      塩見 大輔

      第45回日本分子生物学会年会  2022年12月2日 

      ▶ 詳細を見る

      開催年月日： 2022年11月30日 - 2022年12月2日

      記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（招待・特別）  

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    • スパイロプラズマ細胞分裂タンパク質の機能解析

      笠井 大司, 田原 悠平, 宮田 真人, 塩見 大輔

      第60回日本生物物理学会年会  2022年9月30日 

      ▶ 詳細を見る

      開催年月日： 2022年9月28日 - 2022年9月30日

      記述言語：日本語   会議種別：ポスター発表  

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    • 大腸菌L-formの増殖過程と桿菌への復帰過程におけるZ-ringの制御メカニズム

      林 匡史, 高岡 ちぐさ, 大島 拓, 塩見 大輔

      第16回細菌学若手コロッセウム  2022年8月25日 

      ▶ 詳細を見る

      開催年月日： 2022年8月25日 - 2022年8月27日

      記述言語：日本語   会議種別：口頭発表（一般）  

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    • 大腸菌L-formからの復帰過程における外膜と細胞壁のリンクの役割

      阿蒜 侑佳, 近田 大基, 大島 拓, 塩見 大輔

      第18回21世紀大腸菌研究会  2022年6月28日 

      ▶ 詳細を見る

      開催年月日： 2022年6月27日 - 2022年6月28日

      会議種別：ポスター発表  

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    • スパイロプラズマFtsZとSepFの相互作用とGTPase活性

      笠井大司, 田原悠平, 宮田真人, 塩見大輔

      第18回21世紀大腸菌研究会  2022年6月28日 

      ▶ 詳細を見る

      開催年月日： 2022年6月27日 - 2022年6月28日

      会議種別：ポスター発表  

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    • SanAが関与する大腸菌のペプチドグリカン修復機構の解析

      山口穂野香, 阿合理沙, 田原悠平, 笠井大司, 宮田真人, 塩見大輔

      第18回21世紀大腸菌研究会  2022年6月27日 

      ▶ 詳細を見る

      開催年月日： 2022年6月27日 - 2022年6月28日

      会議種別：口頭発表（一般）  

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    • ペプチドグリカン合成の活性化とZ-ring収縮開始メカニズムの関係性

      林匡史, 高岡ちぐさ, 大島拓, 塩見大輔

      第18回21世紀大腸菌研究会  2022年6月27日 

      ▶ 詳細を見る

      開催年月日： 2022年6月27日 - 2022年6月28日

      会議種別：口頭発表（一般）  

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    • Direct observation of proliferation of cell wall-deficient Escherichia coli cells

      塩見 大輔, 林 匡史, 浪川 結衣, 高岡 ちぐさ, 大島 拓

      第95回日本細菌学会総会（オンライン）  2022年3月29日 

      ▶ 詳細を見る

      開催年月日： 2022年3月29日 - 2022年3月31日

      会議種別：シンポジウム・ワークショップ パネル（指名）  

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    • バクテリアの柔軟な細胞増殖形態の変化 招待有り

      塩見 大輔, 林 匡史, 近田 大基, 浪川 結衣, 高岡 ちぐさ, 大島 拓

      日本農芸化学会 2022年度 京都大会（オンライン）  2022年3月16日 

      ▶ 詳細を見る

      開催年月日： 2022年3月15日 - 2022年3月18日

      会議種別：口頭発表（招待・特別）  

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    • 大腸菌の特殊な増殖様式

      塩見 大輔

      2021年度国立遺伝学研究所研究会「単細胞システムの複製と維持における生体高分子の機能」  2022年3月9日 

      ▶ 詳細を見る

      開催年月日： 2022年3月8日 - 2022年3月9日

      会議種別：口頭発表（一般）  

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    • 細胞壁合成の制御による、Z-ring 収縮開始メカニズムの探索

      林 匡史, 高岡 ちぐさ, 大島 拓, 塩見 大輔

      第16回日本ゲノム微生物学会年会（オンライン）ポスター発表  2022年3月4日 

      ▶ 詳細を見る

      開催年月日： 2022年3月2日 - 2022年3月4日

      会議種別：口頭発表（一般）  

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    • 抗生物質の違いによる大腸菌L-formの代謝変化

      伊藤 わかな, 塩見 大輔, 大島 拓

      第16回日本ゲノム微生物学会年会（オンライン）  2022年3月3日 

      ▶ 詳細を見る

      開催年月日： 2022年3月2日 - 2022年3月4日

      会議種別：ポスター発表  

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    • 大腸菌ペプチドグリカン構築における新規調節因子SanAの機能解析

      山口 穂野香, 阿合 理沙, 田原 悠平, 笠井 大司, 宮田 真人, 塩見 大輔

      第16回日本ゲノム微生物学会年会（オンライン）  2022年3月2日 

      ▶ 詳細を見る

      開催年月日： 2022年3月2日 - 2022年3月4日

      会議種別：ポスター発表  

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    • リアルタイム観察で明らかになってきた大腸菌L-formの増殖様式 招待有り

      塩見大輔

      2021年日本細菌学会関東支部インターラボセミナー（オンライン）  2021年10月21日 

      ▶ 詳細を見る

      開催年月日： 2021年10月21日

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    • 細胞壁を持たない不定形な大腸菌L-formにおける染色体分配様式

      林匡史, 浪川結衣, 大島拓, 塩見大輔

      第93回日本遺伝学会（オンライン）  2021年9月9日 

      ▶ 詳細を見る

      会議種別：口頭発表（一般）  

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    • 大腸菌のバンコマイシン耐性関連因子SanAの機能解析

      山口穂野香, 阿合理沙, 塩見大輔

      第15回細菌学若手コロッセウム（オンライン）  2021年8月30日 

      ▶ 詳細を見る

    • 桿菌・L-form間の分裂様式の返還と分裂装置の制御

      林匡史, 大島拓, 塩見大輔

      第15回細菌学若手コロッセウム（オンライン）  2021年8月30日 

      ▶ 詳細を見る

    • 大腸菌L-formにおける代謝の変化 ~ L-form細胞におけるArcABとFnrの役割 ~

      伊藤わかな, 塩見大輔, 大島拓

      第17回21世紀大腸菌研究会（オンライン）  2021年8月20日 

      ▶ 詳細を見る

      開催年月日： 2021年8月20日

      会議種別：ポスター発表  

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    • ペニシリン結合タンパク質の機能に対するSanAの影響

      山口穂野香, 阿合理沙, 塩見大輔

      第17回21世紀大腸菌研究会（オンライン）  2021年8月20日 

      ▶ 詳細を見る

    • 細胞壁を持たないL-formにおける分裂装置の制御メカニズム

      林匡史, 大島拓, 塩見大輔

      第17回21世紀大腸菌研究会（オンライン）  2021年8月20日 

      ▶ 詳細を見る

    • 細胞壁のない細菌が持つFtsZタンパク質の重合能解析

      笠井大司, 田原悠平, 宮田真人, 塩見大輔

      第17回21世紀大腸菌研究会（オンライン）  2021年8月20日 

      ▶ 詳細を見る

    • 大腸菌L-formにおけるゲノムDNA維持機構の解析

      浪川結衣, 大島拓, 塩見大輔

      第17回21世紀大腸菌研究会（オンライン）  2021年8月20日 

      ▶ 詳細を見る

    • 大腸菌L-formにおける分裂装置の制御メカニズム

      林匡史, 塩見大輔

      第15回日本ゲノム微生物学会年会 （オンライン）  2021年3月5日 

      ▶ 詳細を見る

      会議種別：ポスター発表  

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    • SanAによる大腸菌の新規バンコマイシン耐性機構の解析

      山口穂野香, 阿合理沙, 塩見大輔

      第15回日本ゲノム微生物学会年会 （オンライン）  2021年3月5日 

      ▶ 詳細を見る

      会議種別：ポスター発表  

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    • 異常な細胞壁の再利用が大腸菌L-formに与える影響

      近田大基, 大島拓, 塩見大輔

      第15回日本ゲノム微生物学会年会 （オンライン）  2021年3月5日 

      ▶ 詳細を見る

      会議種別：口頭発表（一般）  

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    • 細胞壁のない細菌の細胞分裂タンパク質の重合能の解析

      笠井大司, 田原悠平, 宮田真人, 塩見大輔

      第15回日本ゲノム微生物学会年会 （オンライン）  2021年3月4日 

      ▶ 詳細を見る

      会議種別：ポスター発表  

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    • 細胞壁のリサイクリングが細胞壁のない大腸菌L-formの増殖に及ぼす影響

      近田大基, 大島拓, 塩見大輔

      第103回日本細菌学会関東支部総会 （オンライン）  2020年10月24日 

      ▶ 詳細を見る

      会議種別：口頭発表（一般）  

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    • 細胞壁を持たない細菌のチューブリンの解析

      笠井大司, 塩見大輔

      第58回日本生物物理学会年会 （オンライン）  2020年9月16日 

      ▶ 詳細を見る

      会議種別：ポスター発表  

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    • ペプチドグリカン層を持たないL型大腸菌の増殖に外膜は重要か？

      塩見大輔, 近田大基, 大島拓

      第14回日本ゲノム微生物学会年会（ウインクあいち）  2020年3月6日 

      ▶ 詳細を見る

      会議種別：口頭発表（一般）  

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    • 大腸菌L-formの増殖における外膜の重要性 招待有り

      塩見大輔, 近田大基, 大島拓

      第93回日本細菌学会総会シンポジウム「バクテリアの表層構造の構築と機能」（ウインクあいち）  2020年2月19日 

      ▶ 詳細を見る

      会議種別：シンポジウム・ワークショップ パネル（指名）  

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    • 細胞壁のない細菌の細胞分裂タンパク質の解析

      笠井大司, 塩見大輔

      第93回日本細菌学会総会（ウインクあいち）  2020年2月19日 

      ▶ 詳細を見る

      会議種別：ポスター発表  

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    • 大腸菌RodZがRod複合体重合を制御する

      阿合理沙, 岡本尚, 仁木宏典, 塩見大輔

      第93回日本細菌学会総会ワークショップ「細菌学若手コロッセウムinみやぎ蔵王 切磋琢磨する若手研究者たち」（ウインクあいち）  2020年2月19日 

      ▶ 詳細を見る

      会議種別：シンポジウム・ワークショップ パネル（指名）  

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    • Rod複合体による大腸菌の形態形成 招待有り

      第42回日本分子生物学会年会 ワークショップ「Frontiers in Microbial Cell Replication System」（福岡国際会議場）  2019年12月4日 

      ▶ 詳細を見る

      会議種別：シンポジウム・ワークショップ パネル（指名）  

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    • 細胞壁を持たないL型大腸菌の増殖機構

      塩見大輔

      遺伝研研究会「微生物における大規模ゲノム・代謝改変技術とその利用」（遺伝研）  2019年11月23日 

      ▶ 詳細を見る

      会議種別：口頭発表（招待・特別）  

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    • 大腸菌のL-form化における細胞壁リサイクリングの重要性

      近田大基, 大島拓, 塩見大輔

      第18回微生物研究会（立教大学）  2019年11月9日 

      ▶ 詳細を見る

    • 大腸菌MreBアクチン動態における細胞膜流動性の重要性

      栗田恵輔, 塩見大輔

      第18回微生物研究会（立教大学）  2019年11月9日 

      ▶ 詳細を見る

      会議種別：ポスター発表  

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    • RodZが関与するRod複合体クラスター構築と細胞形態制御の機構解明

      阿合理沙, 岡本尚, 仁木宏典, 塩見大輔

      第18回微生物研究会（立教大学）  2019年11月9日 

      ▶ 詳細を見る

      会議種別：ポスター発表  

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    • 大腸菌RodZが担う細胞形態維持機構の解明

      阿合理沙, 岡本尚, 仁木宏典, 塩見大輔

      第13回細菌学若手コロッセウム（旬樹庵さんさ亭 宮城・蔵王）  2019年8月18日 

      ▶ 詳細を見る

      会議種別：口頭発表（一般）  

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    • Spiroplasma eriocheiris の細胞分裂タンパク質の機能解析

      笠井大司, 塩見大輔

      第13回細菌学若手コロッセウム（旬樹庵さんさ亭 宮城・蔵王）  2019年8月18日 

      ▶ 詳細を見る

      会議種別：ポスター発表  

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    • 細胞壁を持たない細菌の細胞分裂タンパク質の機能

      笠井大司, 塩見大輔

      第16回21世紀大腸菌研究会（琵琶湖ホテル）  2019年5月29日 

      ▶ 詳細を見る

      会議種別：ポスター発表  

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    • 異なる Mg2+濃度下における大腸菌 L-form 変換過程の解析

      近田大基, 金井友美, 大島 拓, 塩見大輔

      第16回21世紀大腸菌研究会（琵琶湖ホテル）  2019年5月29日 

      ▶ 詳細を見る

      会議種別：口頭発表（一般）  

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    • Rod 複合体新規関連因子 SanA の機能解析

      阿合理沙, 岡本 尚, 仁木宏典, 塩見大輔

      第16回21世紀大腸菌研究会（琵琶湖ホテル）  2019年5月29日 

      ▶ 詳細を見る

      会議種別：口頭発表（一般）  

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    • 細胞壁を持たないスパイロプラズマの分裂

      笠井大司, 塩見大輔

      第92回日本細菌学会総会（札幌コンベンションセンター）  2019年4月23日 

      ▶ 詳細を見る

      会議種別：ポスター発表  

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    • 大腸菌の膜タンパク質RodZとリン脂質による形態制御機構

      Daisuke Shiomi

      第92回日本細菌学会総会（札幌コンベンションセンター）  2019年4月23日 

      ▶ 詳細を見る

      会議種別：シンポジウム・ワークショップ パネル（指名）  

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    • L型大腸菌への変換過程の可視化とその遺伝的基盤の解析

      近田大基, 金井友美, 大島拓, 塩見大輔

      単細胞生物における細胞装置の機能と連携（国立遺伝学研究所）  2019年3月19日 

      ▶ 詳細を見る

      開催年月日： 2019年3月18日 - 2019年3月19日

      会議種別：口頭発表（一般）  

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    • 大腸菌形態形成因子RodZの膜貫通領域の機能解明に向けた遺伝学的解析

      阿合理沙, 岡本尚, 仁木宏典, 塩見大輔

      日本ゲノム微生物学会年会要旨集  2019年3月6日 

      ▶ 詳細を見る

      記述言語：日本語  

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    • 形態形成制御因子RodZタンパク質による効率的なZリング形成

      吉井佑介, 仁木宏典, 塩見大輔

      日本ゲノム微生物学会年会要旨集  2019年3月6日 

      ▶ 詳細を見る

      記述言語：日本語  

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    • シロイヌナズナにおける葉緑体のダイナミクスと炭疽病菌応答への関与~植物と微生物の相互作用,侵略者から用心棒へ~

      入枝泰樹, 入枝泰樹, 高野義孝, 塩見大輔

      日本植物病理学会植物感染生理談話会論文集  2018年8月21日 

      ▶ 詳細を見る

      記述言語：日本語  

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    • RodZタンパク質は細胞分裂面でMerBアクチンとFtsZチューブリンを協調させる

      吉井佑介, 阿合理沙, 仁木宏典, 塩見大輔

      日本ゲノム微生物学会年会要旨集  2018年3月5日 

      ▶ 詳細を見る

      記述言語：日本語  

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    • 大腸菌のMreBアクチンの細胞内動態にリン脂質が与える影響の解析

      栗田恵輔, 加藤郁也, 塩見大輔, 仁木宏典

      日本ゲノム微生物学会年会要旨集  2018年3月5日 

      ▶ 詳細を見る

      記述言語：日本語  

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    • 大腸菌形態形成制御因子MreBアクチンと膜タンパク質RodZの動態の制御

      栗田恵輔, 阿合理沙, 加藤郁也, 仁木宏典, 塩見大輔

      日本農芸化学会大会講演要旨集(Web)  2018年3月5日 

      ▶ 詳細を見る

      記述言語：日本語  

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    • キメラタンパク質によるRodZ膜貫通領域の機能解明

      阿合理沙, 仁木宏典, 塩見大輔

      日本ゲノム微生物学会年会要旨集  2018年3月 

      ▶ 詳細を見る

      記述言語：日本語  

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    • バクテリアアクチンとリン脂質による細胞極性制御

      川面拓真, 松本夏音, 加藤郁也, 金井友美, 仁木宏典, 塩見大輔

      日本ゲノム微生物学会年会要旨集  2017年 

      ▶ 詳細を見る

      記述言語：日本語  

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    • 大腸菌MreBアクチンの細胞内局在の制御機構

      塩見大輔, 川面拓真, 松本夏音, 小島広樹, 加藤郁也, 金井友美, 仁木宏典

      日本細菌学雑誌(Web)  2017年 

      ▶ 詳細を見る

      記述言語：日本語  

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    • バクテリアアクチンが制御する細胞極性

      川面拓真, 小島広樹, 仁木宏典, 塩見大輔

      日本ゲノム微生物学会年会要旨集  2016年 

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      記述言語：日本語  

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    • 膜貫通型タンパク質RodZの膜直下配列の重要性の検討

      塩見大輔, 仁木宏典

      日本ゲノム微生物学会年会要旨集  2015年 

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    • 大腸菌形態制御因子RodZの分裂面への局在とその意義

      塩見大輔, 仁木宏典

      日本ゲノム微生物学会年会要旨集  2013年 

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    • 桿菌の形を決める新規の細胞骨格性タンパク質

      塩見大輔, 境雅子, 仁木宏典

      日本細菌学雑誌  2009年2月20日 

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    • 3P348 大腸菌の細胞分裂によって生じる極性の1細胞計測(その他))

      綾野 賢, 井之上 一平, 塩見 大輔, 川岸 郁朗, 安田 賢二

      生物物理  2005年10月19日 

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    • 3P227 大腸菌全ヒスチジンキナーゼの細胞内局在(細胞生物的課題(接着・運動・骨格・伝達・膜)))

      吉本 誠之, 塩見 大輔, 本間 道夫, 川岸 郁朗

      生物物理  2005年10月19日 

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    • 2P228 大腸菌酸化還元走性センサーAerの細胞内局在とクラスター形成機構の解析(細胞生物的課題(接着・運動・骨格・伝達・膜)))

      太田 徳子, 坂野 聡美, 小幡 祐美, 塩見 大輔, 本間 道夫, 川岸 郁朗

      生物物理  2005年10月19日 

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    • 大腸菌走化性受容体のメチル化による極局性とクラスター内相互作用の制御

      川岸郁朗, 本間道夫, 入枝泰樹, 坂野聡美, 塩見大輔

      日本細菌学雑誌  2005年2月25日 

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    • コレラ菌 Vibrio cholerae の3組のCheシステムとネットワークの細胞内局性

      百武晃宏, 西岡典子, 本間道夫, 川岸郁朗, 伊東靖晃, 塩見大輔

      日本細菌学雑誌  2005年2月25日 

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    • 3P213 化学刺激に対する大腸菌アスパラギン受容体の分子ダイナミクスと運動ダイナミクスの1細胞計測(化学受容)

      井之上 一平, 塩見 大輔, 川岸 郁朗, 安田 賢二

      生物物理  2004年11月10日 

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    • 2P144 大腸菌酸化還元走性センサーAerの細胞内局在と走化性レセプターとの相互作用(細胞生物的課題 : 接着・運動・骨格・伝達・膜)

      小幡 祐美, 塩見 大輔, 本間 道夫, 川岸 郁朗

      生物物理  2004年11月10日 

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    • 2P143 大腸菌走化性における受容体脱メチル化酵素CheBの局在を介した負のフィードバック制御(細胞生物的課題 : 接着・運動・骨格・伝達・膜)

      坂野 聡美, 塩見 大輔, 本間 道夫, 川岸 郁朗

      生物物理  2004年11月10日 

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    • 2P142 大腸菌走化性レセプターの極およびらせん状の局在メカニズム(細胞生物的課題 : 接着・運動・骨格・伝達・膜)

      吉本 誠之, 塩見 大輔, 本間 道夫, 川岸 郁朗

      生物物理  2004年11月10日 

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    • オンチップ1細胞培養系を用いた大腸菌内タンパク発現と細胞運動ダイナミクスの同時顕微鏡計測

      安田賢二, 井之上一平, 若本祐一, 梅原千慶, 川岸郁朗, 塩見大輔

      日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集  2003年11月25日 

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    • オンチップ大腸菌―細胞培養系を用いた走化性レセプター局在ダイナミクスおよび細胞運動能の世代間比較計測

      井之上一平, 若本祐一, 塩見大輔, 川岸郁朗, 安田賢二

      日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集  2003年11月25日 

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    • オンチップ大腸菌-細胞培養系を用いた細胞内蛋白質ダイナミクスの計測

      井之上 一平, 若本 祐一, 塩見 大輔, 川岸 郁朗, 安田 賢二

      生物物理  2003年8月25日 

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    • 大腸菌アスパラギン酸レセプターTarの極クラスターにおけるダイマー間相互作用とシグナル増幅

      本間 幹啓, 塩見 大輔, 本間 道夫, 川岸 郁朗

      生物物理  2003年8月25日 

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    • 脱メチル化酵素CheBによる走化性レセプター・キナーゼ複合体の認識機構

      坂野 聡美, 塩見 大輔, 本間 道夫, 川岸 郁朗

      生物物理  2003年8月25日 

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    • 大腸菌酸化還元走性センサーAerの細胞内局在

      小幡 祐美, 塩見 大輔, 本間 道夫, 川岸 郁朗

      生物物理  2003年8月25日 

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    • 大腸菌走化性レセプターの極へのターゲット機構の解析

      塩見 大輔, 吉本 誠之, 入枝 泰樹, 本間 道夫, 川岸 郁朗

      生物物理  2003年8月25日 

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    • 大腸菌走化性レセプターのダイマー間相互作用に対するメチル化と誘引物質の影響

      本間幹啓, 塩見大輔, 本間道夫, 川岸郁朗

      日本生物物理学会年会講演予稿集  2002年11月 

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    • 大腸菌走化性に関与する脱メチル化酵素CheBの細胞内局在の解析

      坂野聡美, 塩見大輔, 本間道夫, 川岸郁朗

      日本生物物理学会年会講演予稿集  2002年11月 

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    • 大腸菌細胞極における走化性レセプター・キナーゼ複合体形成の制御機構

      塩見大輔, 本間道夫, 川岸郁朗

      日本生物物理学会年会講演予稿集  2002年11月 

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    • 1C0900 大腸菌細胞極における走化性レセプター・キナーゼ複合体形成の制御機構(14.化学受容,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)

      塩見 大輔, 本間 道夫, 川岸 郁朗

      生物物理  2002年10月10日 

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    • 1C0915 大腸菌走化性に関与する脱メチル化酵素CheBの細胞内局在の解析(14.化学受容,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)

      坂野 聡美, 塩見 大輔, 本間 道夫, 川岸 郁朗

      生物物理  2002年10月10日 

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    • 1C0930 大腸菌走化性レセプターのダイマー間相互作用に対するメチル化と誘引物質の影響(14.化学受容,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)

      本間 幹啓, 塩見 大輔, 本間 道夫, 川岸 郁朗

      生物物理  2002年10月10日 

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    • 1C1000 コレラ菌のもつ3種のメチル化酵素CheRホモログの機能解析(14.化学受容,一般演題,日本生物物理学会第40回年会)

      百武 晃宏, 西岡 典子, 塩見 大輔, 本間 道夫, 川岸 郁朗

      生物物理  2002年10月10日 

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    • 大腸菌アスパラギン酸レセプターのクラスター形成とシグナル伝達

      本間幹啓, 塩見大輔, 本間道夫, 川岸郁朗

      生化学  2002年8月25日 

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    • 大腸菌走化性レセプターの極局在化機構

      塩見大輔, 小幡裕美, 本間道夫, 川岸郁朗

      生化学  2002年8月25日 

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    • 大腸菌走化性の適応過程におけるシグナル伝達タンパク質の細胞内局在

      塩見大輔, ZHULIN I, 本間道夫, 川岸郁朗

      日本生物物理学会年会講演予稿集  2001年10月 

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    • 2P169適応におけるメチル化の影響 : 走化性受容体のリガンド結合親和性と極局在の変化

      坂本 博史, 塩見 大輔, 岩間 智徳, 本間 道夫, 川岸 郁朗

      生物物理  2001年9月10日 

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    • 2P168大腸菌走化性の適応過程におけるシグナル伝達タンパク質の細胞内局在

      塩見 大輔, Igor Zhulin, 本間 道夫, 川岸 郁朗

      生物物理  2001年9月10日 

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    • 大腸菌走化性に関与するタンパク質メチル化酵素による走化性レセプター認識機構

      塩見大輔, ZHULIN I B, 本間道夫, 川岸郁朗

      生化学  2001年8月25日 

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    • 大腸菌走化性における膜貫通型レセプターとメチル化酵素の相互作用

      塩見大輔, ZHULIN I B, 本間道夫, 川岸郁朗

      日本遺伝学会大会プログラム・予稿集  2001年8月22日 

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    • 1L0930 大腸菌走化性のメチル基転移酵素CheRの機能解析

      塩見 大輔, Zhulin Igor, 本間 道夫, 川岸 郁朗

      生物物理  2000年8月5日 

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    • 細菌走化性レセプターとメチル基転移酵素の相互作用とその適応における役割

      塩見大輔, 降旗達也, 佐藤健, 本間道夫, 川岸郁朗

      日本生物物理学会年会講演予稿集  1999年9月2日 

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    • 1PA079 細菌走化性レセプターとメチル基転移酵素の相互作用とその適応における役割

      塩見 大輔, 降旗 達也, 佐藤 健, 本間 道夫, 川岸 郁朗

      生物物理  1999年9月2日 

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    • 大腸菌走化性レセプターの適応に重要なメチル化酵素結合部位の解析(1998年度日本味と匂学会第32回大会)

      塩見 大輔, 奥村 尚, 本間 道夫, 川岸 郁朗

      日本味と匂学会誌  1998年12月1日 

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    • 走化性レセプターにおけるメチル基転移酵素系結合配列の変異導入による解析

      塩見 大輔, 奥村 尚, 本間 道夫, 川岸 郁朗

      生物物理  1998年9月7日 

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    所属学協会

    共同研究・競争的資金等の研究

    • ペプチドグリカンを失った大腸菌L-formの増殖機構の解明

      日本学術振興会  科学研究費助成事業 

      塩見 大輔

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      2024年4月 - 2027年3月

      課題番号：24K01673

      配分額：18460000円 （ 直接経費：14200000円 、 間接経費：4260000円 ）

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    • 合成細菌JCVI syn3.0B とゲノム操作を用いた細胞進化モデルの構築

      科学技術振興機構  CREST 

      宮田 真人, 研究者, 塩見 大輔

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      2019年10月 - 2025年3月

      担当区分：研究代表者  資金種別：競争的資金

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    • 細胞骨格タンパク質によるバクテリアの形態形成制御メカニズムの解明

      文部科学省  科学研究費補助金(基盤研究(B)) 

      塩見 大輔

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      2015年 - 2017年

      課題番号：15H04731

      担当区分：研究代表者  資金種別：競争的資金

      配分額：9230000円 （ 直接経費：7100000円 、 間接経費：2130000円 ）

      バクテリアの形態は、真核生物の細胞骨格タンパク質のホモログによって制御されている。本研究では、バクテリアの細胞骨格タンパク質MreBアクチンおよびその制御因子RodZの機能、細胞内局在などを詳細に解析し、バクテリアの形態形成制御メカニズムを解析した。その結果、MreBの細胞内局在および細胞内動態はリン脂質の組成に大きく影響されることを明らかにした。またRodZの自己相互作用領域を明らかにした。加えて、RodZの膜貫通領域がその機能に重要であることも明らかにした。これらの結果は、国際学術誌に２報の論文として、また１報の総説として報告した。現在、さらに研究成果をまとめもう１報の論文を執筆中である。

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    • バクテリア形態形成を制御する複合体の動態と機能解析

      文部科学省  科学研究費補助金(新学術領域研究(研究領域提案型)) 

      塩見 大輔

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      2015年 - 2016年

      課題番号：15H01333

      担当区分：研究代表者  資金種別：競争的資金

      配分額：5850000円 （ 直接経費：4500000円 、 間接経費：1350000円 ）

      1. MreB,RodZタンパク質の細胞内動態解析 本年度はMreB-mCherryまたはGFP-RodZを発現する形態異常株においてこれらのタンパク質の動態を顕微鏡で観察することを計画した。細胞幅が細い変異株や太い変異株を用いて、それらの株におけるMreB-mCherryの動態を調べた。その結果、野生株に比べて細い株ではMreBは速く運動し、逆に、太い株ではMreBは野生株よりも遅く運動することを明らかにした。また、これらの株では一細胞当たりのペプチドグリカン量は変わらなかった。MreBの運動能の違いがペプチドグリカンの構造の違いを生み出し、その結果、細胞幅が異なるのかもしれない。
      <BR>
      2. MreB複合体形成機構 MreBは細胞内で長いフィラメントを形成するという報告と、短いフィラメントあるいはクラスターを形成するという２つの相反する結果が報告されている。実際に、我々の研究室でも、MreBがどちらの状態も取り得ることを観察した。この原因を探るため、個々の細胞のMreBの発現量とMreBの局在を同時に観察する系を構築した。mreBプロモーターの制御下でgfpを発現するプラスミドを構築し、そのプラスミドをMreB-mCherryを発現する株に導入した。この株でGFPとmCherryの発現を同時観察した。その結果、MreBの発現量と局在のパターンに明確な相関は見出されなかった。次に、個々の細胞でのATP濃度の違いがMreBの局在パターンに違いをもたらしている可能性を考えた。ATP濃度はQUEENタンパク質で可視化することを試みた。残念ながら、本年度ではQUEENタンパク質を用いたATP濃度の可視化に成功しなかった。ATP濃度とMreBの局在パターンの関係の解析は今後も継続する予定である。

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    • バクテリア細胞骨格タンパク質複合体の構築と制御機構の解析

      文部科学省  科学研究費補助金(新学術領域研究(研究領域提案型)) 

      塩見 大輔

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      2013年 - 2014年

      課題番号：25117528

      担当区分：研究代表者  資金種別：競争的資金

      配分額：10010000円 （ 直接経費：7700000円 、 間接経費：2310000円 ）

      大腸菌のような桿菌の形態を正しく形成するためには、細胞の短軸方向に沿って回転運動をするバクテリアアクチンMreBが必須である。MreBの重合を含めた機能発現にはその制御因子であるRodZが重要な役割を果たす。そこで、この形態形成に重要な回転する超分子複合体の機能や運動のメカニズムを明らかにするために、再構成系の構築を始めた。好熱菌Thermotoga martimaからMreBおよびRodZを精製した。MreBをAlexa488で標識し、これをリポソームに封入した。予備実験の段階ではあるが、MreBは膜に取り込まれた。そして、リポソーム内で膜全体に広がるもの、クラスターを形成するものが観察された。またRodZも同時に封入した場合、フィラメント様の構造も観察された。また、生体内でこの複合体を構成するタンパク質間相互作用を解析する光架橋実験系を立ち上げた。この実験系により、RodZタンパク質はペリプラズム領域で複数のタンパク質と相互作用することが明らかとなった。このようなタンパク質間相互作用と複合体の動態の関係の解析は今後の課題である。RodZタンパク質の解析も行った。膜タンパク質であるRodZは、膜直下に正電荷を持つアミノ酸を多く持つ。この領域にある正電荷をもつアミノ酸全てをアラニンに置換したが、RodZの機能に影響しなかった。したがって、正電荷は機能に関係しない。また、この領域をMalFタンパク質の細胞質領域と置き換えた。その結果、この領域のアミノ酸配列が必要なのではなく、領域の長さが必要であることが分かった。したがって、ある程度の長さを必要とするリンカーのような役割をしていることが推測された。

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    • 細胞骨格タンパク質複合体による形態形成制御の分子機構の解明

      文部科学省  科学研究費補助金(若手研究(B)) 

      塩見 大輔

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      2012年 - 2013年

      課題番号：24770191

      担当区分：研究代表者  資金種別：競争的資金

      配分額：4550000円 （ 直接経費：3500000円 、 間接経費：1050000円 ）

      本研究では、大腸菌のRodZタンパク質の機能解析を中心として、大腸菌の形態形成制御機構を明らかにすることを目的とした。rodZ欠損株の抑圧変異株の解析からRodZタンパク質の機能の一つがMreBアクチンの重合制御であることが示唆された。この研究成果は論文として公表した。また、RodZタンパク質の細胞膜直下の領域のアミノ酸置換や欠失体の作成により、細胞膜直下の領域のアミノ酸配列は重要ではなく、その領域の長さが重要であることを明らかにした。また、RodZと様々なタンパク質との相互作用解析の結果、RodZを含む超分子複合体内には２つの複合体が存在し、RodZはそれらを橋渡ししていると考えられる。

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    • 新規タンパク質RodZを中心とした原核細胞の形態形成機構の解明

      文部科学省  科学研究費補助金(若手研究(B)) 

      塩見 大輔

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      2010年 - 2011年

      課題番号：22770179

      担当区分：研究代表者  資金種別：競争的資金

      配分額：4290000円 （ 直接経費：3300000円 、 間接経費：990000円 ）

      私は、これまでに新規タンパク質RodZがバクテリアアクチンMreBと共局在することを示していた。本研究では、RodZがMreBとFtsZ(バクテリアチューブリン)に依存して、細胞分裂面に局在することを明らかにした。細胞分裂面に局在できないRodZを発現する株は、細胞幅が太くなった。これまでの研究からRodZは細胞長を制御する因子と考えていたが、本研究からRodZは細胞長と細胞幅を制御する因子であることが示唆された。

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    • 桿状細菌大腸菌の新規形態形成因子の解析

      文部科学省  科学研究費補助金(若手研究(スタートアップ)) 

      塩見 大輔

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      2008年 - 2009年

      課題番号：20870039

      担当区分：研究代表者  資金種別：競争的資金

      配分額：3302000円 （ 直接経費：2540000円 、 間接経費：762000円 ）

      私は、桿状の大腸菌の形態形成制御を司る新規タンパク質RodZを同定した。RodZ欠損株は球形になる。RodZは、細胞長の制御していることが示唆された。また、RodZ欠損株の抑圧変異株の解析から、RodZと他の細胞骨格タンパク質MreB(アクチン)や細胞分裂装置(FtsZチューブリンを含む)との遺伝的相互作用を明らかにした。これは、大腸菌の全ての細胞骨格タンパク質(RodZ,MreB,FtsZ)が協調的に働いていることを示唆している。

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    • 大腸菌走化性におけるタンパク質間相互作用のダイナミクス

      日本学術振興会  科学研究費助成事業 

      塩見 大輔

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      2002年 - 2003年

      課題番号：02J05478

      配分額：2000000円 （ 直接経費：2000000円 ）

      多くの感覚応答系において、入力されたシグナルの増幅は必須である。大腸菌走化性においても、走化性レセプター(MCP)がシグナルタンパク質(CheA,CheWなど)と菌体の極で複合体を形成しており、この極複合体内でのMCPダイマー間の相互作用がシグナル増幅を引き起こすと考えられている。我々は、アスパラギン酸レセプターTarのペリプラズム領域に2つのシステイン残基(サブユニット界面とダイマー間)を導入し、Tarダイマー間の相互作用を調べた。我々は、架橋されたTarが推定6量体を形成することを明らかにした。これはセリンレセプターTsrの細胞質断片の結晶が6量体ユニットを形成することと一致する。また、この推定6量体が誘引物質(アスパラギン酸)の添加により減少した。しかし、アスパラギン酸の添加はTar-GFPの極局在に大きく影響しなかった。つまり、誘引物質の添加により、ダイマー間の相互作用が変化したことが分かる。このようなMCPダイマー間相互作用の変化がシグナル増幅に関与しているかもしれない。
      これまでに、MCPが極に局在していることは明らかになっているが、この極局在がなんらかの制御を受けているかは明らかでない。MCPはCheR,CheBによりメチル化、脱メチル化修飾を受ける。これらの酵素の極局在がMCPのメチル化に依存していることが分かった。これは、これらの標的であるMCPの局在が自身のメチル化に制御されている可能性を示唆している。Tar-GFPのメチル化レベルを変えてTar-GFPの極局在を観察したところ、確かにメチル化レベルが高いほどTar-GFPはより極へ局在した。これは、CheA,CheWがないときにより顕著に観察された。またCheA,CheWがないときに忌避物質を加えると、Tarはクラスターを形成した。このことは、Tar-GFPの極局在がわずかながらもリガンドに制御されていることを示している。また、脱メチル化型Tar-GFPとTsrを共発現させるとTar-GFPの極局在が促進された。このことは、異種レセプターダイマー間で複合体を形成し、極に局在していることを示している。 (一部投稿準備中)

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