研究者詳細 - 岩川　弘宙

2024/10/07 更新

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イワカワ　ヒロオキ

岩川　弘宙

IWAKAWA Hirooki

*大学が定期的に情報更新している項目（その他は、researchmapの登録情報を転載）

所属*

理学部生命理学科
理学研究科生命理学専攻博士課程後期課程
理学研究科生命理学専攻博士課程前期課程

職名*

准教授

学位

博士（農学）（ 2010年3月京都大学）

ホームページ

https://sites.google.com/rikkyo.ac.jp/iwakawalab/home

研究キーワード

RNA

RNAサイレンシング

翻訳

RNAi

microRNA

生化学

植物生理学

植物病理学

ウイルス学

担当科目*

2024年度

学内職務経歴*

2022年4月 - 現在

理学部生命理学科准教授
2022年4月 - 現在

理学研究科生命理学専攻博士課程前期課程准教授
2022年4月 - 現在

理学研究科生命理学専攻博士課程後期課程准教授

外部リンク

研究分野

ライフサイエンス / 分子生物学 / RNA
ライフサイエンス / 分子生物学 / 遺伝子発現制御
ライフサイエンス / 植物分子、生理科学
環境・農学 / 植物保護科学 / 植物病理学

経歴

2022年4月 - 現在

立教大学大学院理学研究科生命理学専攻准教授

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2022年4月 - 現在

立教大学理学部生命理学科准教授

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国名：日本国

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2019年4月 - 2022年3月

東京大学定量生命科学研究所講師

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2018年10月 - 2022年3月

JST さきがけ研究者

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2018年4月 - 2019年3月

東京大学定量生命科学研究所助教

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2015年4月 - 2019年3月

東京大学新領域創成科学研究科メディカル情報生命専攻助教

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2013年4月 - 2018年3月

東京大学分子細胞生物学研究所助教

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2010年4月 - 2013年3月

東京大学分子細胞生物学研究所日本学術振興会特別研究員（PD）

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2007年4月 - 2010年3月

京都大学大学院・農学研究科・応用生物科学専攻日本学術振興会特別研究員（DC1）

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学歴

2007年4月 - 2010年3月

京都大学大学院農学研究科応用生物科学専攻・博士課程

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2005年4月 - 2007年3月

京都大学大学院農学研究科応用生物科学専攻・修士課程

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2001年4月 - 2005年3月

京都大学農学部資源生物科学科

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委員歴

2024年4月 - 現在

日本RNA学会編集幹事

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受賞

2018年

文部科学省平成 30 年度文部科学大臣表彰若手科学者賞

岩川弘宙

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2013年

日本生化学会鈴木紘一メモリアル賞

岩川弘宙

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2006年

日本植物病理学会第一回（平成18年度）学生優秀発表賞

岩川弘宙

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論文

The clade-specific target recognition mechanisms of plant RISCs 査読有り

Hiro-oki Iwakawa

Nucleic Acids Research52 ( 11 ) 6662 - 6673 2024年4月16日

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担当区分：筆頭著者,　最終著者,　責任著者掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：Oxford University Press (OUP)

Abstract

Eukaryotic Argonaut proteins (AGOs) assemble RNA-induced silencing complexes (RISCs) with guide RNAs that allow binding to complementary RNA sequences and subsequent silencing of target genes. The model plant Arabidopsis thaliana encodes 10 different AGOs, categorized into three distinct clades based on amino acid sequence similarity. While clade 1 and 2 RISCs are known for their roles in post-transcriptional gene silencing, and clade 3 RISCs are associated with transcriptional gene silencing in the nucleus, the specific mechanisms of how RISCs from each clade recognize their targets remain unclear. In this study, I conducted quantitative binding analyses between RISCs and target nucleic acids with mismatches at various positions, unveiling distinct target binding characteristics unique to each clade. Clade 1 and 2 RISCs require base pairing not only in the seed region but also in the 3′ supplementary region for stable target RNA binding, with clade 1 exhibiting a higher stringency. Conversely, clade 3 RISCs tolerate dinucleotide mismatches beyond the seed region. Strikingly, they bind to DNA targets with an affinity equal to or surpassing that of RNA, like prokaryotic AGO complexes. These insights challenge existing views on plant RNA silencing and open avenues for exploring new functions of eukaryotic AGOs.

DOI： 10.1093/nar/gkae257

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Mechanisms that regulate the production of secondary siRNAs in plants 招待有り査読有り

Yuji Fujimoto, Hiro-oki Iwakawa

The Journal of Biochemistry174 ( 6 ) 491 - 499 2023年9月26日

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担当区分：最終著者,　責任著者掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：Oxford University Press (OUP)

Abstract

Many organisms produce secondary small interfering RNAs (siRNAs) that are triggered by primary small RNAs to regulate various biological processes. Plants have evolved several types of secondary siRNA biogenesis pathways that play important roles in development, stress responses and defense against viruses and transposons. The critical step of these pathways is the production of double-stranded RNAs by RNA-dependent RNA polymerases. This step is normally tightly regulated, but when its control is released, secondary siRNA production is initiated. In this article, we will review the recent advances in secondary siRNA production triggered by microRNAs encoded in the genome and siRNAs derived from invasive nucleic acids. In particular, we will focus on the factors, events, and RNA/DNA elements that promote or inhibit the early steps of secondary siRNA biogenesis.

DOI： 10.1093/jb/mvad071

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その他リンク： https://academic.oup.com/jb/article-pdf/174/6/491/54447908/mvad071.pdf
植物の二次的小分子RNAの生成機構

藤本祐司, 岩川弘宙

生化学95 ( 3 ) 346 - 350 2023年6月25日

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記述言語：日本語出版者・発行元：公益社団法人日本生化学会

DOI： 10.14952/seikagaku.2023.950346

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The mechanisms of siRNA selection by plant Argonaute proteins triggering DNA methylation 査読有り

Wei Liu, Keisuke Shoji, Masahiro Naganuma, Yukihide Tomari, Hiro-oki Iwakawa

Nucleic Acids Research50 ( 22 ) 12997 - 13010 2022年12月9日

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担当区分：最終著者,　責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：Oxford University Press ({OUP})

Abstract

The model plant Arabidopsis thaliana encodes as many as ten Argonaute proteins (AGO1–10) with different functions. Each AGO selectively loads a set of small RNAs by recognizing their length and 5′ nucleotide identity to properly regulate target genes. Previous studies showed that AGO4 and AGO6, key factors in DNA methylation, incorporate 24-nt small-interfering RNAs with 5′ adenine (24A siRNAs). However, it has been unclear how these AGOs specifically load 24A siRNAs. Here, we biochemically investigated the siRNA preference of AGO4, AGO6 and their chimeric mutants. We found that AGO4 and AGO6 use distinct mechanisms to preferentially load 24A siRNAs. Moreover, we showed that the 5′ A specificity of AGO4 and AGO6 is not determined by the previously known nucleotide specificity loop in the MID domain but rather by the coordination of the MID and PIWI domains. These findings advance our mechanistic understanding of how small RNAs are accurately sorted into different AGO proteins in plants.

DOI： 10.1093/nar/gkac1135

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Functional specialization of monocot DCL3 and DCL5 proteins through the evolution of the PAZ domain 査読有り国際誌

Shirui Chen, Wei Liu, Masahiro Naganuma, *Yukihide Tomari, *Hiro-oki Iwakawa

Nucleic Acids Research50 ( 8 ) 4669 - 4684 2022年4月5日

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担当区分：最終著者,　責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：Oxford University Press (OUP)

Abstract

Monocot DICER-LIKE3 (DCL3) and DCL5 produce distinct 24-nt small interfering RNAs (siRNAs), heterochromatic siRNAs (hc-siRNAs) and phased secondary siRNAs (phasiRNAs), respectively. The former small RNAs are linked to silencing of transposable elements and heterochromatic repeats, and the latter to reproductive processes. It is assumed that these DCLs evolved from an ancient ‘eudicot-type’ DCL3 ancestor, which may have produced both types of siRNAs. However, how functional differentiation was achieved after gene duplication remains elusive. Here, we find that monocot DCL3 and DCL5 exhibit biochemically distinct preferences for 5′ phosphates and 3′ overhangs, consistent with the structural properties of their in vivo double-stranded RNA substrates. Importantly, these distinct substrate specificities are determined by the PAZ domains of DCL3 and DCL5, which have accumulated mutations during the course of evolution. These data explain the mechanism by which these DCLs cleave their cognate substrates from a fixed end, ensuring the production of functional siRNAs. Our study also indicates how plants have diversified and optimized RNA silencing mechanisms during evolution.

DOI： 10.1093/nar/gkac223

PubMed

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Life of RISC: Formation, action, and degradation of RNA-induced silencing complex 招待有り査読有り国際誌

*Hiro-oki Iwakawa, *Yukihide Tomari

Molecular Cell82 ( 1 ) 30 - 43 2022年1月

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担当区分：筆頭著者,　責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：Elsevier BV

Small RNAs regulate a wide variety of biological processes by repressing the expression of target genes at the transcriptional and post-transcriptional levels. To achieve these functions, small RNAs form RNA-induced silencing complex (RISC) together with a member of the Argonaute (AGO) protein family. RISC is directed by its bound small RNA to target complementary RNAs and represses their expression through mRNA cleavage, degradation, and/or translational repression. Many different factors fine-tune RISC activity and stability-from guide-target RNA complementarity to the recruitment of other protein partners to post-translational modifications of RISC itself. Here, we review recent progress in understanding RISC formation, action, and degradation, and discuss new, intriguing questions in the field.

DOI： 10.1016/j.molcel.2021.11.026

PubMed

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Cell-free reconstitution reveals the molecular mechanisms for the initiation of secondary siRNA biogenesis in plants 査読有り国際誌

Yuriki Sakurai, Kyungmin Baeg, Andy Y. W. Lam, Keisuke Shoji, *Yukihide Tomari, *Hiro-oki Iwakawa

Proceedings of the National Academy of Sciences118 ( 31 ) e2102889118 - e2102889118 2021年8月3日

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担当区分：最終著者,　責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1073/pnas.2102889118

PubMed

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その他リンク： https://syndication.highwire.org/content/doi/10.1073/pnas.2102889118
Ribosome stalling caused by the Argonaute-microRNA-SGS3 complex regulates the production of secondary siRNAs in plants 査読有り国際誌

*Hiro-oki Iwakawa, Andy Y.W. Lam, Akira Mine, Tomoya Fujita, Kaori Kiyokawa, Manabu Yoshikawa, Atsushi Takeda, Shintaro Iwasaki, Yukihide Tomari

Cell Reports35 ( 13 ) 109300 - 109300 2021年6月29日

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担当区分：筆頭著者,　責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1016/j.celrep.2021.109300

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Plant 22-nt siRNAs mediate translational repression and stress adaptation

Huihui Wu, Bosheng Li, Hiro-oki Iwakawa, Yajie Pan, Xianli Tang, Qianyan Ling-hu, Yuelin Liu, Shixin Sheng, Li Feng, Hong Zhang, Xinyan Zhang, Zhonghua Tang, Xinli Xia, Jixian Zhai, Hongwei Guo

Nature581 ( 7806 ) 89 - 93 2020年4月29日

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掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：Springer Science and Business Media LLC

DOI： 10.1038/s41586-020-2231-y

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その他リンク： https://www.nature.com/articles/s41586-020-2231-y
In vitro RNA-dependent RNA Polymerase Assay Using Arabidopsis RDR6 招待有り査読有り国際誌

Kyungmin Baeg, Yukihide Tomari, *Hiro-oki Iwakawa.

Bio-protocol8 ( 1 ) e2673 2018年1月

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担当区分：最終著者,　責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.21769/BioProtoc.2673

PubMed

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Silencing messages in a unique way 招待有り査読有り

*Hiro-oki Iwakawa and *Yukihide Tomari.

Nature Plants3 ( 10 ) 769 - 770 2017年10月

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担当区分：筆頭著者,　責任著者記述言語：英語

DOI： 10.1038/s41477-017-0028-2

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Biochemical and single-molecule analyses of the RNA silencing suppressing activity of CrPV-1A 査読有り

Mariko Watanabe, Hiro-oki Iwakawa, Hisashi Tadakuma, Yukihide Tomari

Nucleic Acids Research45 ( 18 ) 10837 - 10844 2017年10月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：OXFORD UNIV PRESS

Viruses often encode viral silencing suppressors (VSSs) to counteract the hosts' RNA silencing activity. The cricket paralysis virus 1A protein (CrPV-1A) is a unique VSS that binds to a specific Argonaute protein (Ago)-the core of the RNA-induced silencing complex (RISC)-in insects to suppress its target cleavage reaction. However, the precise molecular mechanism of CrPV-1A action remains unclear. Here we utilized biochemical and single-molecule imaging approaches to analyze the effect of CrPV-1A during target recognition and cleavage by Drosophila Ago2-RISC. Our results suggest that CrPV-1A obstructs the initial target searching by Ago2-RISC via base pairing in the seed region. The combination of biochemistry and single-molecule imaging may help to pave the way for mechanistic understanding of VSSs with diverse functions.

DOI： 10.1093/nar/gkx748

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Requirement for eukaryotic translation initiation factors in cap-independent translation differs between bipartite genomic RNAs of red clover necrotic mosaic virus 査読有り

Yuri Tajima, Hiro-oki Iwakawa, Kiwamu Hyodo, Masanori Kaido, Kazuyuki Mise, Tetsuro Okuno

Virology509 152 - 158 2017年9月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：ACADEMIC PRESS INC ELSEVIER SCIENCE

The bipartite genomic RNAs of red clover necrotic mosaic virus (RCNMV) lack a 5' cap and a 3' poly(A) tail. RNA1 encodes viral replication proteins, and RNA2 encodes a movement protein (MP). These proteins are translated in a cap-independent manner. We previously identified two cis-acting RNA elements that cooperatively recruit eukaryotic translation initiation factor (eIF) complex eIF4F or eIFiso4F to RNA1. Such cis-acting RNA elements and host factors have not been identified in RNA2. Here we found that translation of RNA1 was significantly compromised in Arabidopsis thaliana carrying eif4f mutation. RNA1 replicated efficiently in eifiso4fl mutants, suggesting vigorous translation of the replication proteins from RNA1 in the plants. In contrast, MP accumulation was decreased in eifiso4f1 mutants but not in eif4f mutants. Collectively, these results suggest that RCNMV uses different eIF complexes for translation of its bipartite genomic RNAs, which may contribute to fine-tuning viral gene expression during infection.

DOI： 10.1016/j.virol.2017.06.015

PubMed

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In Vitro Analysis of ARGONAUTE-Mediated Target Cleavage and Translational Repression in Plants 招待有り

Yukihide Tomari and *Hiro-oki Iwakawa.

Methods in Molecular Biology1640 55 - 71 2017年6月

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担当区分：最終著者,　責任著者記述言語：英語掲載種別：論文集(書籍)内論文

DOI： 10.1007/978-1-4939-7165-7_4

Scopus

PubMed

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The poly(A) tail blocks RDR6 from converting self mRNAs into substrates for gene silencing 査読有り

Kyungmin Baeg, *Hiro-oki Iwakawa and *Yukihide Tomari.

Nature Plants3 ( 4 ) Article number: 17036 2017年4月

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担当区分：責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：NATURE PUBLISHING GROUP

It remains unclear how post-transcriptional gene silencing (PTGS) in plants discriminates aberrant RNAs from canonical messenger RNAs (mRNAs). The key step of plant PTGS is the conversion of aberrant RNAs into double-stranded RNAs by RNA-DEPENDENT RNA POLYMERASE6 (RDR6). Here, we show that RDR6 itself selects aberrant poly(A)-less mRNAs over canonical polyadenylated mRNAs as templates at the initiation step of complementary strand synthesis. This mechanism can be viewed as an innate safeguard against 'self-attack' by PTGS.

DOI： 10.1038/nplants.2017.36

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The Functions of MicroRNAs: mRNA Decay and Translational Repression. 招待有り査読有り

Hiro-oki Iwakawa and Yukihide Tomari.

Trends in cell biology25 ( 11 ) 651 - 665 2015年11月

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担当区分：筆頭著者記述言語：英語

DOI： 10.1016/j.tcb.2015.07.011

PubMed

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MicroRNAs Block Assembly of eIF4F Translation Initiation Complex in Drosophila 査読有り

#Takashi Fukaya, #Hiro-oki Iwakawa, Yukihide Tomari.

Molecular Cell56 ( 1 ) 67 - 78 2014年10月

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担当区分：筆頭著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：CELL PRESS

miRNAs silence their complementary target mRNAs by translational repression as well as by poly(A) shortening and mRNA decay. In Drosophila, miRNAs are typically incorporated into Argonaute1 (Ago1) to form the effector complex called RNA-induced silencing complex (RISC). Ago1-RISC associates with a scaffold protein GW182, which recruits additional silencing factors. We have previously shown that miRNAs repress translation initiation by blocking formation of the 48S and 80S ribosomal complexes. However, it remains unclear how ribosome recruitment is impeded. Here, we examined the assembly of translation initiation factors on the target mRNA under repression. We show that Ago1-RISC induces dissociation of eIF4A, a DEAD-box RNA helicase, from the target mRNA without affecting 50 cap recognition by eIF4E in a manner independent of GW182. In contrast, direct tethering of GW182 promotes dissociation of both eIF4E and eIF4A. We propose that miRNAs act to block the assembly of the eIF4F complex during translation initiation.

DOI： 10.1016/j.molcel.2014.09.004

PubMed

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Molecular Insights into microRNA-Mediated Translational Repression in Plants

Hiro-oki Iwakawa, Yukihide Tomari

Molecular Cell52 ( 4 ) 591 - 601 2013年11月

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担当区分：筆頭著者掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：Elsevier BV

DOI： 10.1016/j.molcel.2013.10.033

PubMed

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Arabidopsis ARGONAUTE7 selects miR390 through multiple checkpoints during RISC assembly. 査読有り

Yayoi Endo, *Hiro-oki Iwakawa and *Yukihide Tomari.

EMBO reports14 ( 7 ) 652 - 658 2013年7月

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担当区分：責任著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1038/embor.2013.73

PubMed

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Poly(A)-Binding Protein Facilitates Translation of an Uncapped/Nonpolyadenylated Viral RNA by Binding to the 3 ' Untranslated Region 査読有り

Hiro-oki Iwakawa, Yuri Tajima, Takako Taniguchi, Masanori Kaido, Kazuyuki Mise, Yukihide Tomari, Hisaaki Taniguchi and Tetsuro Okuno.

Journal of Virology86 ( 15 ) 7836 - 7849 2012年8月

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担当区分：筆頭著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：AMER SOC MICROBIOLOGY

Viruses employ an alternative translation mechanism to exploit cellular resources at the expense of host mRNAs and to allow preferential translation. Plant RNA viruses often lack both a 5' cap and a 3' poly(A) tail in their genomic RNAs. Instead, cap-independent translation enhancer elements (CITEs) located in the 3' untranslated region (UTR) mediate their translation. Although eukaryotic translation initiation factors (eIFs) or ribosomes have been shown to bind to the 3' CITEs, our knowledge is still limited for the mechanism, especially for cellular factors. Here, we searched for cellular factors that stimulate the 3' CITE-mediated translation of Red clover necrotic mosaic virus (RCNMV) RNA1 using RNA aptamer-based one-step affinity chromatography, followed by mass spectrometry analysis. We identified the poly(A)-binding protein (PABP) as one of the key players in the 3' CITE-mediated translation of RCNMV RNA1. We found that PABP binds to an A-rich sequence (ARS) in the viral 3' UTR. The ARS is conserved among dianthoviruses. Mutagenesis and a tethering assay revealed that the PABP-ARS interaction stimulates 3' CITE-mediated translation of RCNMV RNAl. We also found that both the ARS and 3' CITE are important for the recruitment of the plant eIF4F and eIFiso4F factors to the 3 ' UTR and of the 40S ribosomal subunit to the viral mRNA. Our results suggest that dianthoviruses have evolved the ARS and 3' CITE as substitutes for the 3' poly(A) tail and the 5' cap of eukaryotic mRNAs for the efficient recruitment of eIFs, PABP, and ribosomes to the uncapped/nonpolyadenylated viral mRNA.

DOI： 10.1128/JVI.00538-12

PubMed

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A long-distance RNA-RNA interaction plays an important role in programmed-1 ribosomal frameshifting in the translation of p88 replicase protein of Red clover necrotic mosaic virus 査読有り

Yuri Tajima, Hiro-oki Iwakawa, Masanori Kaido, Kazuyuki Mise, Tetsuro Okuno

Virology417 ( 1 ) 169 - 178 2011年8月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：ACADEMIC PRESS INC ELSEVIER SCIENCE

Programmed - 1 ribosomal frameshifting (- 1 PRF) is one viral translation strategy to express overlapping genes in positive-strand RNA viruses. Red clover necrotic mosaic virus ( RCNMV) uses this strategy to express its replicase component protein p88. In this study, we used a cell-free translation system to map cis-acting RNA elements required for 1 PRF. Our results show that a small stem-loop structure adjacent to the cap-independent translation element in the 3' untranslated region (UTR) of RCNMV RNA1 is required for - 1 PRF. Site-directed mutagenesis experiments suggested that this stem-loop regulates - 1 PRF via base-pairing with complementary sequences in a bulged stem-loop adjacent to the shifty site. The existence of RNA elements responsible for - 1 PRF and the cap-independent translation of replicase proteins in the 3' UTR of RNA1 might be important for switching translation to replication and for regulating the ratio of p88 to p27. (C) 2011 Published by Elsevier

DOI： 10.1016/j.virol.2011.05.012

PubMed

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Identification of amino acids in auxiliary replicase protein p27 critical for its RNA-binding activity and the assembly of the replicase complex in Red clover necrotic mosaic virus. 査読有り

Kiwamu Hyodo, Akira Mine, Hiro-oki Iwakawa, Masanori Kaido, Kazuyuki Mise and Tetsuro Okuno.

Virology413 ( 2 ) 300 - 309 2011年5月

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DOI： 10.1016/j.virol.2011.02.017

PubMed

CiNii Article

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Template Recognition Mechanisms by Replicase Proteins Differ between Bipartite Positive-Strand Genomic RNAs of a Plant Virus 査読有り

Hiro-oki Iwakawa, Akira Mine, Kiwamu Hyodo, Mengnan An, Masanori Kaido, Kazuyuki Mise, Tetsuro Okuno

Journal of Virology85 ( 1 ) 497 - 509 2011年1月

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担当区分：筆頭著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）出版者・発行元：AMER SOC MICROBIOLOGY

Recognition of RNA templates by viral replicase proteins is one of the key steps in the replication process of all RNA viruses. However, the mechanisms underlying this phenomenon, including primary RNA elements that are recognized by the viral replicase proteins, are not well understood. Here, we used aptamer pulldown assays with membrane fractionation and protein-RNA coimmunoprecipitation in a cell-free viral translation/replication system to investigate how viral replicase proteins recognize the bipartite genomic RNAs of the Red clover necrotic mosaic virus (RCNMV). RCNMV replicase proteins bound specifically to a Y-shaped RNA element (YRE) located in the 3' untranslated region (UTR) of RNA2, which also interacted with the 480-kDa replicase complexes that contain viral and host proteins. The replicase-YRE interaction recruited RNA2 to the membrane fraction. Conversely, RNA1 fragments failed to interact with the replicase proteins supplied in trans. The results of protein-RNA coimmunoprecipitation assays suggest that RNA1 interacts with the replicase proteins coupled with their translation. Thus, the initial template recognition mechanisms employed by the replicase differ between RCNMV bipartite genomic RNAs and RNA elements are primary determinants of the differential replication mechanism.

DOI： 10.1128/JVI.01754-10

PubMed

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A Y-shaped RNA structure in the 3' untranslated region together with the trans-activator and core promoter of Red clover necrotic mosaic virus RNA2 is required for its negative-strand RNA synthesis. 査読有り

Mengnan An, Hiro-oki Iwakawa, Akira Mine, Masanori Kaido, Kazuyuki Mise and Tetsuro Okuno.

Virology405 ( 1 ) 100 - 109 2010年9月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1016/j.virol.2010.05.022

PubMed

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Host-dependent roles of the viral 5' untranslated region (UTR) in RNA stabilization and cap-independent translational enhancement mediated by the 3' UTR of Red clover necrotic mosaic virus RNA1. 査読有り

Siriruk Sarawaneeyaruk, Hiro-oki Iwakawa, Hiroyuki Mizumoto, Hiromi Murakami, Masanori Kaido, Kazuyuki Mise and Tetsuro Okuno.

Virology391 ( 1 ) 107 - 118 2009年8月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1016/j.virol.2009.05.037

PubMed

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A viral noncoding RNA generated by cis-element-mediated protection against 5'->3' RNA decay represses both cap-independent and cap-dependent translation. 査読有り

Hiro-oki Iwakawa, Hiroyuki Mizumoto, Hideaki Nagano, Yuka Imoto, Kazuma Takigawa, Siriruk Sarawaneeyaruk, Masanori Kaido, Kazuyuki Mise and Tetsuro Okuno.

Journal of virology82 ( 20 ) 10162 - 10174 2008年10月

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担当区分：筆頭著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1128/JVI.01027-08

PubMed

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cis-Preferential requirement of a -1 frameshift product p88 for the replication of Red clover necrotic mosaic virus RNA1. 査読有り

Kimiyuki Okamoto, Hideaki Nagano, Hiro-oki Iwakawa, Hiroyuki Mizumoto, Atsushi Takeda, Masanori Kaido, Kazuyuki Mise and Tetsuro Okuno.

Virology375 ( 1 ) 205 - 212 2008年5月

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記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1016/j.virol.2008.02.004

PubMed

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cis-Acting core RNA elements required for negative-strand RNA synthesis and cap-independent translation are separated in the 3'-untranslated region of Red clover necrotic mosaic virus RNA1. 査読有り

Hiro-oki Iwakawa, Masanori Kaido, Kazuyuki Mise and Tetsuro Okuno.

Virology369 ( 1 ) 168 - 181 2007年12月

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担当区分：筆頭著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1016/j.virol.2007.07.016

Scopus

PubMed

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Cap-independent translation mechanism of red clover necrotic mosaic virus RNA2 differs from that of RNA1 and is linked to RNA replication. 査読有り

#Hiroyuki Mizumoto, #Hiro-oki Iwakawa, Masanori Kaido, Kazuyuki Mise and Tetsuro Okuno.

Journal of virology80 ( 8 ) 3781 - 3791 2006年4月

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担当区分：筆頭著者記述言語：英語掲載種別：研究論文（学術雑誌）

DOI： 10.1128/JVI.80.8.3781-3791.2006

PubMed

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MISC

自然免疫における環状RNAの役割

岩川弘宙

実験医学38 ( 3 ) 436 - 437 2020年2月

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担当区分：筆頭著者,　最終著者,　責任著者

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植物のRNAサイレンシング機構招待有り査読有り

岩川弘宙

植物感染生理談話会論文集 ( 53 ) 46 - 56 2018年8月

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記述言語：日本語掲載種別：記事・総説・解説・論説等（その他）

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植物のRNAサイレンシング機構が自己のmRNAを攻撃しないメカニズム招待有り査読有り

岩川弘宙

植物科学最前線8 58 - 70 2017年

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記述言語：日本語掲載種別：記事・総説・解説・論説等（その他）

DOI： 10.24480/bsj-review.8b4.00114

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植物と動物におけるmicroRNAによる翻訳制御機構招待有り

岩川弘宙, 泊幸秀

化学と生物53 ( 8 ) 510 - 514 2015年

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記述言語：日本語出版者・発行元：公益社団法人日本農芸化学会

タンパク質をコードしていない20塩基から30塩基程度の小分子RNAは，相補的な配列をもつ標的遺伝子の発現を負に制御する．核にコードされている小分子RNAであるmicroRNA（miRNA）が内在の相補的な遺伝子を抑制するシステムは動植物で保存されており，分化，発生やストレス応答などさまざまな生体反応を緻密に制御している．本稿では植物のmiRNAが標的の遺伝子を抑制するメカニズム，特にこれまで理解が進んでいなかったmiRNA依存的な翻訳抑制機構について動物のmiRNA機構と比較しながら解説する．

DOI： 10.1271/kagakutoseibutsu.53.510

CiNii Article

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その他リンク： http://search.jamas.or.jp/link/ui/2015323429
miRNAによる翻訳開始因子複合体の形成の阻害招待有り

深谷雄志, 岩川弘宙, 泊幸秀

ライフサイエンス新着論文レビュー 2014年

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植物におけるマイクロRNAを介した翻訳抑制機構招待有り

岩川弘宙, 泊幸秀

ライフサイエンス新着論文レビュー 2013年

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RNAサイレンシングのしくみ招待有り

岩川弘宙, 泊幸秀

週刊「医学のあゆみ」238 ( 5 ) 388 - 393 2011年

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Red clover necrotic mosaic virus RNA複製酵素成分タンパク質p27はウイルスRNAの初期複製段階において様々な役割を担っている

兵頭究, 峯彰, 岩川弘宙, 海道真典, 三瀬和之, 奥野哲郎

日本ウイルス学会学術集会プログラム・抄録集58th 2010年

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J-GLOBAL

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Red clover necrotic mosaic virus RNA複製酵素成分タンパク質p27のRNA結合活性はウイルスゲノムRNA2の複製初期段階に重要である

兵頭究, 峯彰, 岩川弘宙, 海道真典, 三瀬和之, 奥野哲郎

日本植物病理学会大会プログラム・講演要旨予稿集2010 2010年

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J-GLOBAL

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Red clover necrotic mosaic virus RNA複製酵素成分タンパク質におけるウイルスRNAの膜へのリクルートに関わる機能ドメイン解析

兵頭究, 峯彰, 岩川弘宙, 海道真典, 三瀬和之, 奥野哲郎

日本ウイルス学会学術集会プログラム・抄録集57th 2009年

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J-GLOBAL

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ウイルスが生み出す様々なノンコーディング RNA

岩川弘宙, 奥野哲郎

ウイルス59 ( 2 ) 179 - 188 2009年

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記述言語：日本語出版者・発行元：日本ウイルス学会

近年, microRNA (miRNA) やsmall interfering RNA (siRNA) を含むノンコーディング RNAが遺伝子発現制御,あるいはウイルスやトランスポゾンといった分子パラサイトに対する防御応答に関わっているとこが次々と明らかとされてきた. 一方，ウイルスもまた効率の良い複製や潜在感染を成し遂げるために, さまざまな種類のノンコーディング RNAを用いることにより宿主やウイルス自身の遺伝子発現を時間的・空間的に制御していることが分かってきた. 本稿では，最初にDNAウイルスより生み出されるノンコーディング RNAの生成機構と機能を概説し, 次に植物と動物のRNAウイルスから生み出される新しいタイプのノンコーディングRNAの生成機構とその機能を紹介する.

DOI： 10.2222/jsv.59.179

CiNii Article

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(277) Red clover necrotic mosaic virus RNA1に由来するノンコーディングRNAの生成メカニズムと機能解析(平成20年度日本植物病理学会大会講演要旨)

岩川弘宙, 水本祐之, 海道真典, 三瀬和之, 奥野哲郎

日本植物病理學會報74 ( 3 ) 240 - 241 2008年8月25日

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記述言語：日本語出版者・発行元：日本植物病理学会

CiNii Article

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(279) レッドクローバーネクロティックモザイクウイルスRNA2の3'UTRに存在する二つの新規なステムループ構造はRNA2の複製に重要である(平成20年度日本植物病理学会大会講演要旨)

安夢楠, 岩川弘宙, 海道真典, 三瀬和之, 奥野哲郎

日本植物病理學會報74 ( 3 ) 241 - 241 2008年8月25日

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記述言語：日本語出版者・発行元：日本植物病理学会

CiNii Article

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(281) Red clover necrotic mosaic virus RNA1の3'翻訳促進因子によるキャップ非依存的翻訳はリボソームスキャニング機構を利用する(平成20年度日本植物病理学会大会講演要旨)

サラワニヤラックシリラック, 岩川弘宙, 海道真典, 三瀬和之, 奥野哲郎

日本植物病理學會報74 ( 3 ) 241 - 242 2008年8月25日

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記述言語：英語出版者・発行元：日本植物病理学会

CiNii Article

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(257) Red clover necrotic mosaic virusのマイナス鎖RNA合成に小胞体膜は必須か?(平成19年度日本植物病理学会大会講演要旨)

岩川弘宙, 海道真典, 三瀬和之, 奥野哲郎

日本植物病理學會報73 ( 3 ) 244 - 244 2007年8月25日

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記述言語：日本語出版者・発行元：日本植物病理学会

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(258) 共免疫沈降法を用いたRed clover necrotic mosaic virusの複製酵素成分タンパク質間の相互作用の解析(平成19年度日本植物病理学会大会講演要旨)

峯彰, 岩川弘宙, 竹田篤史, 海道直典, 三瀬和之, 奥野哲郎

日本植物病理學會報73 ( 3 ) 244 - 244 2007年8月25日

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記述言語：日本語出版者・発行元：日本植物病理学会

CiNii Article

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(259) Red clover necrotic mosaic virus(RCNMV) RNA1とサブゲノムRNA1aのキャップ非依存性翻訳における5'非翻訳領域の役割(平成19年度日本植物病理学会大会講演要旨)

サラワニヤラックシリラック, 岩川弘宙, 村上裕美, 水本祐之, 海道真典, 三瀬和之, 奥野哲郎

日本植物病理學會報73 ( 3 ) 244 - 244 2007年8月25日

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記述言語：英語出版者・発行元：日本植物病理学会

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ダイアンソウイルスゲノムRNAの3'末端近傍に保存されている新規ステムループ構造は複製に必須である(関西部会講演要旨,平成18年度地域部会講演要旨)

岩川弘宙, 海道真典, 三瀬和之, 奥野哲郎

日本植物病理學會報73 ( 1 ) 69 - 69 2007年2月25日

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記述言語：日本語出版者・発行元：日本植物病理学会

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(331) Red clover necrotic mosaic virus (RCNMV)のRNA複製複合体に含まれる宿主植物因子の探索(平成18年度日本植物病理学会大会講演要旨)

峯彰, 岩川弘宙, 竹田篤史, 海道真典, 三瀬和之, 奥野哲郎

日本植物病理學會報72 ( 4 ) 290 - 290 2006年11月25日

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記述言語：日本語出版者・発行元：日本植物病理学会

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(330) BYL in vitro翻訳複製系を用いたRed clover necrotic mosaic virus RNA1の翻訳と複製のシス因子の解析(平成18年度日本植物病理学会大会講演要旨)

岩川弘宙, 村上裕美, 水本祐之, 海道真典, 三瀬和之, 奥野哲郎

日本植物病理學會報72 ( 4 ) 290 - 290 2006年11月25日

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記述言語：日本語出版者・発行元：日本植物病理学会

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Red clover necrotic mosaic virus RNA1から転写される新規サブゲノムRNAプロモーターの解析(関西部会講演要旨,平成17年度地域部会講演要旨)

井本裕佳, 岡本公如, 岩川弘宙, 滝川業磨, 水本祐之, 海道真典, 三瀬和之, 奥野哲郎

日本植物病理學會報72 ( 1 ) 81 - 81 2006年2月25日

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記述言語：日本語出版者・発行元：日本植物病理学会

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(268) Red clover necrotic mosaic virus RNA1から転写される新規サブゲノムRNAのプロモーターは転写領域内に存在する(平成17年度日本植物病理学会大会講演要旨)

滝川業磨, 水本祐之, 岩川弘宙, 海道真典, 三瀬和之, 奥野哲郎

日本植物病理學會報71 ( 3 ) 256 - 257 2005年8月25日

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記述言語：日本語出版者・発行元：日本植物病理学会

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(269) Red clover necrotic mosaic virus RNA1から転写されるサブゲノムRNA1bはRNA1の翻訳を抑制する(平成17年度日本植物病理学会大会講演要旨)

岩川弘宙, 水本祐之, 滝川業磨, 海道真典, 三瀬和之, 奥野哲郎

日本植物病理學會報71 ( 3 ) 257 - 257 2005年8月25日

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記述言語：日本語出版者・発行元：日本植物病理学会

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(98) Red clover necrotic mosaic virus RNA1から転写される新規サブゲノムRNA(関西部会講演要旨, 平成16年度地域部会講演要旨)

滝川業磨, 水本祐之, 岩川弘宙, 海道真典, 三瀬和之, 奥野哲郎

日本植物病理學會報71 ( 1 ) 78 - 78 2005年2月25日

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記述言語：日本語出版者・発行元：日本植物病理学会

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担当経験のある科目（授業）

2023年4月 - 現在

特別研究２

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2023年4月 - 現在

特別研究指導（生物化学）

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2023年4月 - 現在

生命理学ゼミナール１（立教大学）

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2023年4月 - 現在

生物化学特論２（立教大学）

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2022年9月 - 現在

生命理学の最前線（立教大学）

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2022年9月 - 現在

生物化学１（生命）（立教大学）

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2022年4月 - 現在

輪講2

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2022年4月 - 現在

修士論文指導演習

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2022年4月 - 現在

輪講（立教大学）

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2022年4月 - 現在

卒業研究（立教大学）

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2022年4月 - 現在

生命理学実験２Ａ（立教大学）

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2022年4月 - 現在

生命理学基礎実験（立教大学）

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2022年4月 - 現在

自然科学の探究（立教大学）

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2022年4月 - 現在

基礎情報科学（生命）（立教大学）

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2019年4月 - 2021年3月

全学自由研究ゼミナール「生命科学の最前線」（東京大学）

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全学体験ゼミナール（東京大学）

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共同研究・競争的資金等の研究

植物RNAiの理解と応用:自在な人工ゲノム発現にむけて

国立研究開発法人科学技術振興機構（JST）創発的研究支援事業

岩川弘宙

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2022年4月 - 2029年3月

担当区分：研究代表者

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植物病原体サプレッサーによるＲＮＡサイレンシング阻害機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業

吉川学, 韓龍雲, 岩川弘宙, 向原隆文

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2023年4月 - 2027年3月

課題番号：23H02218

担当区分：研究分担者

配分額：18720000円（直接経費：14400000円、間接経費：4320000円）

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小分子RNA増幅機構の解明：反応場の「真の役割」

日本学術振興会科学研究費助成事業

岩川弘宙, 吉川学

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2023年4月 - 2026年3月

課題番号：23H02412

配分額：18850000円（直接経費：14500000円、間接経費：4350000円）

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ウイルス抵抗性研究の高度化に資するゲノム編集タバコプラットフォーム確立への挑戦

日本学術振興会科学研究費助成事業

竹田篤史, 岩川弘宙

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2022年6月 - 2025年3月

課題番号：22K19186

担当区分：研究分担者

配分額：6500000円（直接経費：5000000円、間接経費：1500000円）

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遺伝子増幅装置と染色体ベクターの構築

科学技術振興機構戦略的な研究開発の推進戦略的創造研究推進事業 CREST

小林武彦

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2019年 - 2024年

担当区分：研究分担者

任意の遺伝子を増幅することができる遺伝子増幅システムを構築します。またその増幅システムを用いて100以上の遺伝子を組み込むことができる「染色体ベクター」を作成します。ここにタンパク質複合体や代謝系に関わる遺伝子を丸ごと組み込み、それらを異種細胞内で再構築し解析する実験系を確立します。将来的には人工細胞の作成の基盤技術になると期待します。

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小分子RNA依存的リボソーム停滞機構の統合的理解

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A)

岩川弘宙

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2021年9月 - 2023年3月

課題番号：21H05717

配分額：10400000円（直接経費：8000000円、間接経費：2400000円）

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大規模ゲノム改変を可能にするRNAサイレンシング回避技術の確立

国立研究開発法人科学技術振興機構（JST）さきがけ研究

岩川弘宙

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2018年10月 - 2022年3月

担当区分：研究代表者資金種別：競争的資金

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核内小分子RNAの作用メカニズムの解明

独立行政法人日本学術振興会(JSPS) 若手研究(A)

岩川弘宙

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2016年4月 - 2019年3月

担当区分：研究代表者資金種別：競争的資金

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mRNAとタンパク質の品質管理機構における新生鎖の新規機能の解明

独立行政法人日本学術振興会(JSPS) 新学術領域研究(研究領域提案型)

稲田利文

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2014年7月 - 2019年3月

資金種別：競争的資金

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二次的小分子RNA生成における反応モジュール間連動機構の解明

独立行政法人日本学術振興会(JSPS) 挑戦的萌芽研究

岩川弘宙

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2015年4月 - 2018年3月

担当区分：研究代表者資金種別：競争的資金

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植物microRNAによる翻訳抑制機構の解明

独立行政法人日本学術振興会(JSPS) 研究活動スタート支援

岩川弘宙

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2013年4月 - 2015年3月

担当区分：研究代表者資金種別：競争的資金

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植物におけるｓｍａｌｌＲＮＡ依存的翻訳抑制機構の生化学的解析

独立行政法人日本学術振興会(JSPS) 特別研究員奨励費

岩川弘宙

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2010年 - 2012年

担当区分：研究代表者資金種別：競争的資金

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ダイアンソウイルスの遺伝子発現制御と複製機構の解明

独立行政法人日本学術振興会(JSPS) 特別研究員奨励費

岩川弘宙

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2007年 - 2009年

担当区分：研究代表者資金種別：競争的資金

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