2024/02/02 更新

写真b

クリハラ エミコ
栗原 恵美子
KURIHARA Emiko
*大学が定期的に情報更新している項目(その他は、researchmapの登録情報を転載)
所属*
理学部 生命理学科
職名*
助教
学位
博士(生命科学) ( 東京大学 )
研究キーワード
  • ケミカルバイオロジー

  • バイオイメージング

  • 植物細胞

  • シングルセル解析

  • 学内職務経歴*
    • 2023年4月 - 現在 
      理学部   生命理学科   助教
     

    研究分野

    • ライフサイエンス / 細胞生物学  / 光形態形成

    • ライフサイエンス / 分子生物学  / ケミカルバイオロジー

    • ライフサイエンス / 細胞生物学  / 植物細胞生物学

    経歴

    • 2018年4月 - 2023年3月 
      理化学研究所   環境資源科学研究センター   研究員

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    • 2012年5月 - 2018年3月 
      理化学研究所   環境資源科学研究センター   特別研究員

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    • 2010年11月 - 2012年3月 
      University of California, San Diego   Cell and Developmental Biology

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    委員歴

    • - 2023年3月 
      理化学研究所男女共同参画委員

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    受賞

    • 2017年3月  
      理化学研究所  理研桜舞賞(理研研究奨励賞) 

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    論文

    • "Advances in single-cell metabolomics to unravel cellular heterogeneity in plant biology". 招待有り 査読有り 国際誌

      Kanchana Pandian, Minami Matsui, Thomas Hankemeier, Ahmed Ali, Emiko Okubo-Kurihara

      Plant physiology   2023年6月20日

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      記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

      Single-cell metabolomics is a powerful tool that can reveal cellular heterogeneity and can elucidate the mechanisms of biological phenomena in detail. It is a promising approach in studying plants, especially when cellular heterogeneity has an impact on different biological processes. In addition, metabolomics, which can be regarded as a detailed phenotypic analysis, is expected to answer previously unanswered questions which will lead to expansion of crop production, increased understanding of resistance to diseases, and in other applications as well. In this review, we will introduce the flow of sample acquisition, and single-cell metabolomics techniques to facilitate the adoption of single-cell metabolomics. Furthermore, the applications of single cell metabolomics will be summarized and reviewed.

      DOI: 10.1093/plphys/kiad357

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    • Tracking metabolites at single-cell resolution reveals metabolic dynamics during plant mitosis. 査読有り 国際誌

      Emiko Okubo-Kurihara, Ahmed Ali, Mika Hiramoto, Yukio Kurihara, Yasmine Abouleila, Eman Muhammad Abdelazem, Takayuki Kawai, Yuko Makita, Mika Kawashima, Tsuyoshi Esaki, Hiroaki Shimada, Tetsuya Mori, Masami Yokota Hirai, Takumi Higaki, Seiichiro Hasezawa, Yoshihiro Shimizu, Tsutomu Masujima, Minami Matsui

      Plant physiology189 ( 2 ) 459 - 464   2022年3月18日

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      担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

      Analyzing only one cell allows the changes and characteristics of intracellular metabolites during the chromosome segregation process to be precisely captured and mitotic sub-phases to be dissected at the metabolite level.

      DOI: 10.1093/plphys/kiac093

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    • Identification of a dual orange/far-red and blue light photoreceptor from an oceanic green picoplankton. 査読有り 国際誌

      Yuko Makita, Shigekatsu Suzuki, Keiji Fushimi, Setsuko Shimada, Aya Suehisa, Manami Hirata, Tomoko Kuriyama, Yukio Kurihara, Hidefumi Hamasaki, Emiko Okubo-Kurihara, Kazutoshi Yoshitake, Tsuyoshi Watanabe, Masaaki Sakuta, Takashi Gojobori, Tomoko Sakami, Rei Narikawa, Haruyo Yamaguchi, Masanobu Kawachi, Minami Matsui

      Nature communications12 ( 1 ) 3593 - 3593   2021年6月16日

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      記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

      Photoreceptors are conserved in green algae to land plants and regulate various developmental stages. In the ocean, blue light penetrates deeper than red light, and blue-light sensing is key to adapting to marine environments. Here, a search for blue-light photoreceptors in the marine metagenome uncover a chimeric gene composed of a phytochrome and a cryptochrome (Dualchrome1, DUC1) in a prasinophyte, Pycnococcus provasolii. DUC1 detects light within the orange/far-red and blue spectra, and acts as a dual photoreceptor. Analyses of its genome reveal the possible mechanisms of light adaptation. Genes for the light-harvesting complex (LHC) are duplicated and transcriptionally regulated under monochromatic orange/blue light, suggesting P. provasolii has acquired environmental adaptability to a wide range of light spectra and intensities.

      DOI: 10.1038/s41467-021-23741-5

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    • Method for Phenotypic Chemical Screening to Identify Cryptochrome Inhibitors. 招待有り 国際誌

      Emiko Okubo-Kurihara, Wen-Dee Ong, Yukio Kurihara, Natsumaro Kutsuna, Minami Matsui

      Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)2213   17 - 27   2021年

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      担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

      After germination, plants determine their morphogenesis, such as hypocotyl elongation and cotyledon opening, by responding to various wavelengths of light (photomorphogenesis). Cryptochrome is a blue-light photoreceptor that controls de-etiolation, stomatal opening and closing, flowering time, and shade avoidance. Successful incorporation of these phenotypes as indicators into a chemical screening system results in faster selection of candidate compounds. Here, we describe phenotypic screening for the blue-light response of Arabidopsis thaliana seedling and the resulting process that clarifies that the compound obtained in the screening is an inhibitor of cryptochromes.

      DOI: 10.1007/978-1-0716-0954-5_2

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    • Regulatory Potential of bHLH-Type Transcription Factors on the Road to Rubber Biosynthesis in Hevea brasiliensis. 査読有り 国際誌

      Tomoko Yamaguchi, Yukio Kurihara, Yuko Makita, Emiko Okubo-Kurihara, Ami Kageyama, Emi Osada, Setsuko Shimada, Hiroko Tsuchida, Hiroaki Shimada, Minami Matsui

      Plants (Basel, Switzerland)9 ( 6 )   2020年5月26日

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      記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

      Natural rubber is the main component of latex obtained from laticifer cells of Hevea brasiliensis. For improving rubber yield, it is essential to understand the genetic molecular mechanisms responsible for laticifer differentiation and rubber biosynthesis. Jasmonate enhances both secondary laticifer differentiation and rubber biosynthesis. Here, we carried out time-course RNA-seq analysis in suspension-cultured cells treated with methyljasmonic acid (MeJA) to characterize the gene expression profile. Gene Ontology (GO) analysis showed that the term "cell differentiation" was enriched in upregulated genes at 24 hours after treatment, but inversely, the term was enriched in downregulated genes at 5 days, indicating that MeJA could induce cell differentiation at an early stage of the response. Jasmonate signaling is activated by MYC2, a basic helix-loop-helix (bHLH)-type transcription factor (TF). The aim of this work was to find any links between transcriptomic changes after MeJA application and regulation by TFs. Using an in vitro binding assay, we traced candidate genes throughout the whole genome that were targeted by four bHLH TFs: Hb_MYC2-1, Hb_MYC2-2, Hb_bHLH1, and Hb_bHLH2. The latter two are highly expressed in laticifer cells. Their physical binding sites were found in the promoter regions of a variety of other TF genes, which are differentially expressed upon MeJA exposure, and rubber biogenesis-related genes including SRPP1 and REF3. These studies suggest the possibilities that Hb_MYC2-1 and Hb_MYC2-2 regulate cell differentiation and that Hb_bHLH1 and Hb_bHLH2 promote rubber biosynthesis. We expect that our findings will help to increase natural rubber yield through genetic control in the future.

      DOI: 10.3390/plants9060674

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    • 画像解析技術を活用した“観て測る”植物科学

      檜垣 匠, 栗原(大窪) 恵美子

      植物科学の最前線10 ( B ) 49 - 50   2019年

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      出版者・発行元:公益社団法人 日本植物学会  

      DOI: 10.24480/bsj-review.10b1.00154

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    • Phenotype-Based Screening of Small Molecules to Modify Plant Cell Walls Using BY-2 Cells. 査読有り 国際誌

      Emiko Okubo-Kurihara, Minami Matsui

      Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)1795   85 - 92   2018年

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      記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

      The plant cell wall is an important and abundant biomass with great potential for use as a modern recyclable resource. For effective utilization of this cellulosic biomass, its ability to degrade efficiently is key point. With the aim of modifying the cell wall to allow easy decomposition, we used chemical biological technology to alter its structure. As a first step toward evaluating the chemicals in the cell wall we employed a phenotype-based approach using high-throughput screening. As the plant cell wall is essential in determining cell morphology, phenotype-based screening is particularly effective in identifying compounds that bring about alterations in the cell wall. For rapid and reproducible screening, tobacco BY-2 cell is an excellent system in which to observe cell morphology. In this chapter, we provide a detailed chemical biological methodology for studying cell morphology using tobacco BY-2 cells.

      DOI: 10.1007/978-1-4939-7874-8_7

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    • Chemical-Induced Inhibition of Blue Light-Mediated Seedling Development Caused by Disruption of Upstream Signal Transduction Involving Cryptochromes in Arabidopsis thaliana. 査読有り

      Wen-Dee Ong, Emiko Okubo-Kurihara, Yukio Kurihara, Setsuko Shimada, Yuko Makita, Mika Kawashima, Kaori Honda, Yasumitsu Kondoh, Nobumoto Watanabe, Hiroyuki Osada, Sean R Cutler, Kumar Sudesh, Minami Matsui

      Plant & cell physiology58 ( 1 ) 95 - 105   2017年1月1日

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      記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:OXFORD UNIV PRESS  

      Plants have a remarkable ability to perceive and respond to various wavelengths of light and initiate regulation of different cascades of light signaling and molecular components. While the perception of red light and the mechanisms of its signaling involving phytochromes are largely known, knowledge of the mechanisms of blue light signaling is still limited. Chemical genetics involves the use of diverse small active or synthetic molecules to evaluate biological processes. By combining chemicals and analyzing the effects they have on plant morphology, we identified a chemical, 3-bromo-7-nitroindazole (3B7N), that promotes hypocotyl elongation of wild-type Arabidopsis only under continuous blue light. Further evaluation with loss-of-function mutants confirmed that 3B7N inhibits photomorphogenesis through cryptochrome-mediated light signaling. Microarray analysis demonstrated that the effect of 3B7N treatment on gene expression in cry1cry2 is considerably smaller than that in the wild type, indicating that 3B7N specifically interrupts cryptochrome function in the control of seedling development in a light-dependent manner. We demonstrated that 3B7N directly binds to CRY1 protein using an in vitro binding assay. These results suggest that 3B7N is a novel chemical that directly inhibits plant cryptochrome function by physical binding. The application of 3B7N can be used on other plants to study further the blue light mechanism and the genetic control of cryptochromes in the growth and development of plant species.

      DOI: 10.1093/pcp/pcw181

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    • Modification of plant cell wall structure accompanied by enhancement of saccharification efficiency using a chemical, lasalocid sodium. 査読有り 国際誌

      Emiko Okubo-Kurihara, Misato Ohtani, Yukio Kurihara, Koichi Kakegawa, Megumi Kobayashi, Noriko Nagata, Takanori Komatsu, Jun Kikuchi, Sean Cutler, Taku Demura, Minami Matsui

      Scientific reports6   34602 - 34602   2016年10月3日

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      記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

      The cell wall is one major determinant of plant cell morphology, and is an attractive bioresource. Here, we report a novel strategy to modify plant cell wall property by small molecules. Lasalocid sodium (LS) was isolated by chemical screening to identify molecules that affect the cell morphology of tobacco BY-2 cells. LS treatment led to an increase in cell wall thickness, whilst the quantity and sugar composition of the cell wall remained unchanged in BY-2 cells. The chemical also disordered the cellular arrangement of hypocotyls of Arabidopsis plants, resulting in a decrease in hypocotyl length. LS treatment enhanced enzymatic saccharification efficiency in both BY-2 cells and Arabidopsis plants. Microarray analysis on Arabidopsis showed that exposure to LS upregulated type III peroxidase genes, of which some are involved in lignin biogenesis, and jasmonic acid response genes, and phloroglucinol staining supported the activation of lignification by the LS treatment. As jasmonic acid-mediated lignification is a typical reaction to cell wall damage, it is possible that LS induces cell wall loosening, which can trigger cell wall damage response. Thus, LS is a unique chemical for modification of cell wall and morphology through changes in cell wall architecture.

      DOI: 10.1038/srep34602

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    • Polycistronic expression of RNA silencing suppressor protects its own mRNA from RNA silencing 査読有り

      Yukio Kurihara, Emiko Okubo-Kurihara, Minami Matsui

      PLANT BIOTECHNOLOGY32 ( 1 ) 89 - 95   2015年3月

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      記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)   出版者・発行元:JAPANESE SOC PLANT CELL & MOLECULAR BIOLOGY  

      The internal ribosome entry site (IRES) enables polycistronic expression of multiple genes from a single mRNA controlled by one promoter. In general, only the most 5' coding sequence is abundantly translated from polycistronic mRNAs in eukaryotic cells; IRES-mediated translation allows additional coding sequences at other positions to be translated at detectable levels. However, IRES-mediated translation often results in much lower protein expression than translation of single-gene mRNAs. We first aimed to improve IRES-mediated gene expression with a transient expression system based on Nicotiana benthamiana. We demonstrated that the presence of two cassettes comprised of an IRES-mediated Venus coding sequence results in higher Venus expression than one cassette. The double IRES cassette system is expected to be useful for expressing a gene of interest polycistronically in plants. Using the double IRES cassette system, we found that polycistronic expression of a reporter gene and two copies of an IRES-mediated RNA silencing suppressor gene protected the transcribed mRNA from RNA silencing-mediated degradation. This is the first report of a mRNA self-protection system from RNA silencing by IRES-mediated expression of a viral suppressor in plants.

      DOI: 10.5511/plantbiotechnology.15.0120b

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    • Surveillance of 3' Noncoding Transcripts Requires FIERY1 and XRN3 in Arabidopsis. 査読有り 国際誌

      Yukio Kurihara, Robert J Schmitz, Joseph R Nery, Matthew D Schultz, Emiko Okubo-Kurihara, Taeko Morosawa, Maho Tanaka, Tetsuro Toyoda, Motoaki Seki, Joseph R Ecker

      G3 (Bethesda, Md.)2 ( 4 ) 487 - 98   2012年4月

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      記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

      Eukaryotes possess several RNA surveillance mechanisms that prevent undesirable aberrant RNAs from accumulating. Arabidopsis XRN2, XRN3, and XRN4 are three orthologs of the yeast 5'-to-3' exoribonuclease, Rat1/Xrn2, that function in multiple RNA decay pathways. XRN activity is maintained by FIERY1 (FRY1), which converts the XRN inhibitor, adenosine 3', 5'-bisphosphate (PAP), into 5'AMP. To identify the roles of XRNs and FRY1 in suppression of non-coding RNAs, strand-specific genome-wide tiling arrays and deep strand-specific RNA-Seq analyses were carried out in fry1 and xrn single and double mutants. In fry1-6, about 2000 new transcripts were identified that extended the 3' end of specific mRNAs; many of these were also observed in genotypes that possess the xrn3-3 mutation, a partial loss-of-function allele. Mutations in XRN2 and XRN4 in combination with xrn3-3 revealed only a minor effect on 3' extensions, indicating that these genes may be partially redundant with XRN3. We also observed the accumulation of 3' remnants of many DCL1-processed microRNA (miRNA) precursors in fry1-6 and xrn3-3. These findings suggest that XRN3, in combination with FRY1, is required to prevent the accumulation of 3' extensions that arise from thousands of mRNA and miRNA precursor transcripts.

      DOI: 10.1534/g3.111.001362

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    • Sucrose transporter NtSUT4 from tobacco BY-2 involved in plant cell shape during miniprotoplast culture. 査読有り

      Emiko Okubo-Kurihara, Takumi Higaki, Yukio Kurihara, Natsumaro Kutsuna, Junji Yamaguchi, Seiichiro Hasezawa

      Journal of plant research124 ( 3 ) 395 - 403   2011年5月

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      担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

      Sucrose plays an important role in several cellular processes since it is a general source of metabolic energy, serves as a precursor for starch and cellulose synthesis, and is a metabolic starting point for carboxylate- and amino acid synthesis. While plant vacuole is the main cellular storage pool, where sucrose accumulates to high concentrations, only a small number of vacuolar sugar transporters have been identified and characterized to date. We initially identified a vacuolar sucrose transporter (NtSUT4) from tobacco BY-2 cells and established transgenic tobacco BY-2 cell lines that overexpress NtSUT4-GFP (BY-SUTG cells). Using a model system for synchronous cell elongation in miniprotoplasts (evacuolated cells) prepared from tobacco BY-2 cells, we found that NtSUT4-GFP overexpression inhibited cell growth towards the cell major axis. Moreover, under the same conditions, we found that the cell walls were well stained by calcofluor in BY-SUTG cells than in wild type BY-2 cells. These results suggest that NtSUT4 is involved in cell shape via sucrose homeostasis in plant cells.

      DOI: 10.1007/s10265-010-0377-7

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    • Acceleration of vacuolar regeneration and cell growth by overexpression of an aquaporin NtTIP1;1 in tobacco BY-2 cells. 査読有り

      Emiko Okubo-Kurihara, Toshio Sano, Takumi Higaki, Natsumaro Kutsuna, Seiichiro Hasezawa

      Plant & cell physiology50 ( 1 ) 151 - 60   2009年1月

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      担当区分:筆頭著者   記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

      Aquaporin is a water channel that increases water permeability through membranous structures. In plants, vacuoles are essential organelles that undergo dynamic volume changes during cell growth. To understand the contribution of aquaporins to plant cell growth, we developed a transgenic tobacco BY-2 cell line overexpressing the tonoplast intrinsic protein (TIP), gammaTIP. Vacuolar membranes of isolated vacuoles from gammaTIP-overexpressing cells showed higher water permeation activities than those from wild-type cells. We then examined the role of gammaTIP in vacuolar regeneration of evacuolated tobacco BY-2 protoplasts (miniprotoplasts). Vacuolar regeneration from thin to thick tube-network vacuoles and subsequent development of large vacuoles was accelerated in miniprotoplasts of this cell line. A parallel increase in the rate of cell expansion indicated a tight relationship between vacuolar development and cellular volume increases. Interestingly, overexpression of tobacco gammaTIP also enhanced cell division. Thus, increased vacuolar aquaporin activity may accelerate both cell expansion and cell division by increasing water permeability through the vacuolar membrane.

      DOI: 10.1093/pcp/pcn181

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    • Actin microfilaments regulate vacuolar structures and dynamics: dual observation of actin microfilaments and vacuolar membrane in living tobacco BY-2 Cells.

      Takumi Higaki, Natsumaro Kutsuna, Emiko Okubo, Toshio Sano, Seiichiro Hasezawa

      Plant & cell physiology47 ( 7 ) 839 - 52   2006年7月

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      記述言語:英語   掲載種別:研究論文(学術雑誌)  

      Actin microfilaments (MFs) participate in many fundamental processes in plant growth and development. Here, we report the co-localization of the actin MF and vacuolar membrane (VM), as visualized by vital VM staining with FM4-64 in living tobacco BY-2 cells stably expressing green fluorescent protein (GFP)-fimbrin (BY-GF11). The MFs were intensively localized on the VM surface and at the periphery of the cytoplasmic strands rather than at their center. The co-localization of MFs and VMs was confirmed by the observation made using transient expression of red fluorescent protein (RFP)-fimbrin in tobacco BY-2 cells stably expressing GFP-AtVam3p (BY-GV7) and BY-2 cells stably expressing gamma-tonoplast intrinsic protein (gamma-TIP)-GFP fusion protein (BY-GG). Time-lapse imaging revealed dynamic movement of MF structures which was parallel to that of cytoplasmic strands. Disruption of MF structures disorganized cytoplasmic strand structures and produced small spherical vacuoles in the VM-accumulating region. Three-dimensional reconstructions of the vacuolar structures revealed a disconnection of these small spherical vacuoles from the large vacuoles. Real-time observations and quantitative image analyses demonstrated rapid movements of MFs and VMs near the cell cortex, which were inhibited by the general myosin ATPase inhibitor, 2,3-butanedion monoxime (BDM). Moreover, both bistheonellide A (BA) and BDM treatment inhibited the reorganization of the cytoplasmic strands and the migration of daughter cell nuclei at early G1 phase, suggesting a requirement for the acto-myosin system for vacuolar morphogenesis during cell cycle progression. These results suggest that MFs support the vacuolar structures and that the acto-myosin system plays an essential role in vacuolar morphogenesis.

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    MISC

    • 新規光受容体・Dualchromeの生物的機能解析

      嶋田勢津子, 蒔田由布子, 鈴木重勝, 伏見圭司, 陶久あや, 平田愛美, 平田愛美, 栗山朋子, 栗原志夫, 濱崎英史, 栗原(大窪)恵美子, 吉武和敏, 渡辺剛, 坂見知子, 作田正明, 五條堀孝, 成川礼, 山口晴代, 河地正伸, 松井南

      日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM)85th   2021年

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    • 新規光受容体・Dualchromeは橙色光/遠赤色光と青色光を感知する

      成川礼, 伏見圭司, 蒔田由布子, 鈴木重勝, 嶋田勢津子, 陶久あや, 平田愛美, 栗山朋子, 栗原志夫, 濱崎英史, 栗原(大窪)恵美子, 吉武和敏, 渡辺剛, 坂見知子, 作田正明, 五条堀孝, 山口晴代, 河地正伸, 松井南

      日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM)85th   2021年

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    • 海洋メタゲノムデータからの新規光受容体・Dualchromeの発見

      蒔田由布子, 鈴木重勝, 伏見圭司, 嶋田勢津子, 栗山朋子, 栗原志夫, 濱崎英史, 栗原恵美子, 成川礼, 成川礼, 山口晴代, 河地正伸, 松井南

      日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM)85th   2021年

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    • 海洋メタゲノムデータからの赤色光,遠赤色光,青色光を感知する融合型光受容体の発見

      蒔田由布子, 鈴木重勝, 伏見圭司, 嶋田勢津子, 平田愛実, 陶久あや, 栗山朋子, 栗原志夫, 濱崎英史, 栗原恵美子, 吉武和敏, 渡辺剛, 坂見知子, 作田正明, 五條堀孝, 成川礼, 成川礼, 山口晴代, 河地正伸, 松井南

      日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web)44th   2021年

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    • 天然ゴムの生合成に関連する転写因子及びその結合部位の同定

      山口朋子, 山口朋子, 長田恵美, 長田恵美, 蔭山杏実, 蔭山杏実, 栗原志夫, 蒔田由布子, 嶋田勢津子, 栗原(大窪)恵美子, 土田博子, 島田浩章, 松井南

      日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web)42nd   2019年

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    • 形態変化を指標にした青色光受容体阻害化合物の同定

      栗原(大窪)恵美子, 朽名夏麿, 栗原志夫, 松井南

      植物科学の最前線(Web)10   2019年

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    • 天然ゴムの生合成を制御する転写因子及びその結合部位の同定

      山口朋子, 山口朋子, 栗原志夫, 蒔田由布子, 川島美香, 嶋田勢津子, 栗原恵美子, 土田博子, 島田浩章, 松井南

      日本植物細胞分子生物学会大会・シンポジウム講演要旨集36th   2018年

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    • フェノタイプベーススクリーニングによるゴム様粒子誘導化合物の探索・解析

      栗原(大窪)恵美子

      日本植物学会大会研究発表記録82nd   2018年

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    • 天然ゴム生合成経路の独特さ,複雑さをケミカルジェネティクスで解く-ゲノムとケミカル双方向からのアプローチ-

      栗原(大窪)恵美子

      日本植物生理学会年会(Web)59th   2018年

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    • 細胞分裂期の生体分子の挙動をシングルセルレゾリューションで知る-前・中・後・終期のオミックス解析

      大窪(栗原)恵美子

      日本植物学会大会研究発表記録81st   2017年

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    • 植物の有糸分裂の各期における1細胞を用いた高解像度なメタボローム解析

      平元美佳, 平元美佳, 栗原(大窪)恵美子, 栗原志夫, 蒔田由布子, 桧垣匠, 馳澤盛一郎, 松井南

      日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web)39th   2016年

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    • シロイヌナズナにおける青色光シグナル経路を阻害する低分子化合物の同定および解析

      栗原恵美子, ONG Wen-Dee, 栗原志夫, 嶋田勢津子, CUTLER Sean, KUMAR Sudesh, 松井南

      日本植物学会大会研究発表記録80th   2016年

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    • 細胞壁を変化させる低分子化合物の探索・解析

      栗原(大窪)恵美子, 栗原志夫, 大谷美沙都, 小林恵, 永田典子, 小松功典, 菊地淳, 菊地淳, 掛川弘一, 出村拓, 出村拓, 松井南

      日本植物学会大会研究発表記録78th   2014年

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    • タバコの液胞膜型ショ糖トランスポーター(NtSUT4)の同定と機能の生理学的解析

      大窪(栗原) 恵美子, 桧垣匠, 桧垣匠, 栗原志夫, 朽名夏麿, 朽名夏麿, 山口淳二, 馳澤盛一郎, 馳澤盛一郎

      日本植物生理学会年会要旨集51st   2010年

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    • 植物の生長におけるタバコの液胞膜型アクアポリン(NtTIP1;1)の機能解析

      大窪(栗原)恵美子, 佐野俊夫, 林誠, 桧垣匠, 桧垣匠, 朽名夏麿, 朽名夏麿, 馳澤盛一郎, 馳澤盛一郎

      日本植物学会大会研究発表記録73rd   2009年

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    • 液胞の発達を伴う細胞生長におけるタバコの液胞膜型アクアポリン(NtTIP1;1)の機能解析

      大窪恵美子, 大窪恵美子, 朽名夏麿, 朽名夏麿, 桧垣匠, 桧垣匠, 佐野俊夫, 佐野俊夫, 馳澤盛一郎, 馳澤盛一郎

      日本植物生理学会年会要旨集49th   2008年

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    • 液胞の発達過程におけるタバコBY-2液胞膜型アクアポリン(NtγTIP)の関与

      大窪恵美子, 桧垣匠, 朽名夏麿, 佐野俊夫, 馳澤盛一郎

      日本植物生理学会年会要旨集48th   2007年

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    • 植物における液胞の立体構造と動態:立体再構築と動画像解析によるアプローチ

      朽名夏麿, 小田祥久, 桧垣匠, 大窪恵美子, 佐野俊夫, 馳澤盛一郎

      日本植物生理学会年会要旨集48th   2007年

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    • タバコBY-2ミニプロトプラストの細胞生長時における細胞骨格の役割

      大窪恵美子, 朽名夏麿, 桧垣匠, 佐野俊夫, 馳澤盛一郎

      日本植物生理学会年会要旨集47th   2006年

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    • タバコBY-2ミニプロトプラストにおける巨大液胞再形成過程の構造解析

      大窪恵美子, 朽名夏麿, 桧垣匠, 佐野俊夫, 馳沢盛一郎

      日本分子生物学会年会講演要旨集28th   2005年

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    書籍等出版物

    • サステナブルとゴム : ゴム業界から考える、これからの百年

      鈴木, 希実( 担当: その他 ,  範囲: P16-17, P62-67)

      ポスティコーポレーション  2022年12月  ( ISBN:9784910227092

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      総ページ数:107p   記述言語:日本語

      CiNii Books

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    担当経験のある科目(授業)

    • 2023年9月 
      生物学実験(物)

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    • 2023年4月 - 2023年7月 
      生命理学実験2A

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    • 2023年4月 - 2023年7月 
      生命理学基礎実験

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    • 2023年4月 - 2023年7月 
      生命理学ゼミナール2

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    • 2023年4月 
      卒業研究

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    • 2022年 - 2022年 
      化学生命科学特別講義II (学部) / 生物学特別講義(大学院) ( 日本女子大学 )

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    • 2007年9月 - 2008年3月 
      生命科学概論実験II ( 日本女子大学 )

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    所属学協会

    共同研究・競争的資金等の研究

    • 未分化パラゴムノキ培養細胞を駆使した天然ゴム合成システムの確立

      日本学術振興会  科学研究費助成事業 挑戦的研究(萌芽) 

      栗原 恵美子

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      2022年6月 - 2024年3月

      課題番号:22K19883

      配分額:6370000円 ( 直接経費:4900000円 、 間接経費:1470000円 )

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    • 植物の細胞分裂期における1細胞オミックス解析

      日本学術振興会  科学研究費助成事業 挑戦的研究(萌芽) 

      栗原 恵美子, 川島 美香

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      2017年6月 - 2019年3月

      課題番号:17K19363

      配分額:5850000円 ( 直接経費:4500000円 、 間接経費:1350000円 )

      分裂期の細胞動態は時空間的に精巧に制御されており、それらは分子レベルでも厳密な制御がなされているはずであるが、これら現象に対応するオミックス情報はほとんど不明であった。本研究課題ではまず染色体の状態から分裂前、中、後、終期を判断し、目的の細胞のみを取得し、オミックス解析を行う手法を確立した。分裂期の各時期における詳細な代謝変動および遺伝子発現を明らかにした。その結果、前期、中期、後期、終期の間においても明白な代謝物の変動および遺伝子の発現があることを見出した。さらに、時期特異的に蓄積している代謝物質、脂質の傾向を解析することにより前、中、後、終期の特徴を抽出することができた。

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    • ケミカルフェノミクスによる植物のサイズを制御する低分子化合物の探索

      日本学術振興会  科学研究費助成事業 挑戦的萌芽研究 

      栗原 恵美子

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      2013年4月 - 2015年3月

      課題番号:25560421

      配分額:3510000円 ( 直接経費:2700000円 、 間接経費:810000円 )

      本研究ではバイオマスの増産を目的とし、低分子化合物ライブラリを処理した植物の表現型を解析することで、有用な低分子化合物を探索した。まず、シロイヌナズナ種子にケミカルを添加した後、青色光下で培養し、画像を取得・評価した。開発した計算プログラムを用い、22項目について定量的な数値を算出した。本研究では植物が伸長し、子葉の面積が小さいフェノタイプを持つもので特に著しく差異を示した化合物の#203を候補とした。#203を添加すると、青色光下のみで伸長が亢進した。#203およびその類似化合物について遺伝子発現解析を行ったところ、#203のみ青色光受容関連遺伝子の発現に変化が起こらないことを明らかにした。

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    産業財産権

    • クリプトクロムの機能を抑制するための組成物

      松井 南, 栗原 志夫, 栗原 恵美子, オン ウェンディ, 川島 美香, 蒔田 由布子, クマール スーディッシュ

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      出願人:国立研究開発法人理化学研究所

      出願番号:特願2016-205506  出願日:2016年10月19日

      公開番号:特開2018-065766  公開日:2018年4月26日

      特許番号/登録番号:特許第6835308号  登録日:2021年2月8日 

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    • 植物細胞壁肥厚促進剤及び植物細胞壁分解促進剤

      栗原 恵美子, 栗原 志夫, 松井 南

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      出願人:国立研究開発法人理化学研究所

      出願番号:特願2014-244940  出願日:2014年12月3日

      公開番号:特開2015-129117  公開日:2015年7月16日

      J-GLOBAL

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    社会貢献活動

    • 科学道100冊 2019

      取材協力, 情報提供

      2019年

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      種別:その他

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    • 科学道100冊 2021

      取材協力, 助言・指導, 情報提供

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